看过我TCGA肿瘤数据库知识图谱的小伙伴都只是如何在任意癌症查询指定感兴趣基因的表达量,并且对样本进行分组比较,网...[作者空间]
刘小泽写于19.7.18+28官方总共有7个数据集,涵盖了新版本的不同亮点这一次跟着教程https://satij...[作者空间]
刘小泽写于19.7.18之前接触过scRNA的Seurat包 2.X版本,后来2019.4.16正式升级到了3,虽...[作者空间]
1 介绍 针对基因大量样本量表达数据的分析方法(RNA-seq 、微阵列),建议样本数量大于15,可以挖掘具有相...[作者空间]
关于拟时分析的一些基本知识请参看以下两篇及其参考文章: scRNA-seq拟时分析 || Monocle2 踩坑教...[作者空间]
相信每个做生物信息或者生物统计的同学都避免不了要做主成分分析(Principal Component Analys...[作者空间]
主要功能与界面[作者空间]
FGNet介绍 FGNet(Functional Gene Networks derived from bio...[作者空间]
生信完全入门线路图及资源大全 原文链接:生信完全入门线路图及资源大全 - 生信技能树 成为一个合格的生信工程师必经...[作者空间]
SCENIC是一种基于单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具 这里介绍的步骤方法是针对在R...[作者空间]
DAVID搞定功能通路富集分析 说起DAVID,没有涉及过高通的小伙伴们会以为这是一个人名,而对高通量稍有了解的人...[作者空间]
【CIBERSORT】超详细,从数据下载到数据分析全过程(初学者笔记) cibersort是目前引用次数最多的免疫...[作者空间]
为了争夺“5G”,美国接连针对中国通信公司。去年4月16日,美国商务部公布对中兴制裁,折腾了4个多月,交了14亿美...[作者空间]
How to map cell fate to branches? 拟时间分析结果有很多重要的结果,但是这些结果如...[作者空间]
参考 http://www.bio-info-trainee.com/2535.htmlWGCNA分析,简单全面的...[作者空间]
声明:文中提到的网站本是为了方便自己,仅个人使用。现在分享出来做演示(绝不是广告),我还担心网友太多挤垮我的小破站...[作者空间]
上传DEGs gene_list到String 调整分析参数 然后下载tsv文件 同时下载图片 将前两列导入到cy...[作者空间]
UCSC Xena允许用户探索基因组和/或表型变量之间相关性的功能基因组数据集。其囊括TCGA等多个数据库的数据。...[作者空间]
DEseq预热 主要就是这几个步骤了。 1. counts: 查看每个样本在每个基因上的counts数 2. 构建...[作者空间]
本文首发于 ”百味科研芝士“ 微信公众号,转载请注明:百味科研芝士,Focus科研人的百味需求 相信小伙伴们通过我...[作者空间]