表达矩阵的归一化和标准化，去除极端值，异常值 今天在学习转录组知识，在进行做表达量热图时候发现表达量差值很大，于是...[作者空间]
中游分析这个词是我杜撰的，用来强调表达矩阵构建过程并不简单。 0 前言 前几天Jimmy老师发了一篇 我用这个技能...[作者空间]
太长不看版本 DESeq 最新版本（v1.25.9）针对大样本分析的速度和之前相比有了质的飞越，果子老师的 121...[作者空间]
在四周之前，我写了一篇推送一个月能通过转录组入门生信吗？，于是开启了我的‘四周通过实战入门转录组’计划。现在四周结...[作者空间]
转录组分析策略 转录组分析策略根据有无参考转录组可以分为两类： 有参比对—定量—差异分析—功能富集分析等 无参组装...[作者空间]
我们第一周目标有三个: 熟悉Linux环境登录服务器Linux基本命令PATH的意义 学习conda管理环境如何在...[作者空间]
deepTools 是一套基于python开发的工具，适用于有效处理分析高通量测序数据，可用于ChIP-seq, ...[作者空间]
3大数据库超2万RNA-seq数据重新统一处理 各种大型计划产出的RNA-seq数据资源已经非常丰富了，但是大家都...[作者空间]
写在前面之一：出于兴趣和知识整理的初衷，写了这篇博文，给网上众多RNA-Seq教程添砖加瓦，也给像我一点一点踩坑的...[作者空间]
在线工具也能追上单细胞 作者：白介素2 单细胞测序技术是一个越来越Popular的技术，这不前两天还有小伙伴来找白...[作者空间]
写在前面 很荣幸参加生信技能树全国巡讲-第一站-重庆站的RNA-seq线下培训课程。以下为线下课结合线上课所做的笔...[作者空间]
最近读到一篇博文，介绍了学习 RNAseq 数据分析非常推荐的两篇综述和七个在线教程并发表了相关评论。本文将进行简...[作者空间]
测序容易，解读困难 现在大部分同学做转录组实验都是让测序公司去分析，经过了那么多年的发展，公司提供的分析结果也是越...[作者空间]
目录 标准化1.1. House-keeping gene(s)1.2. spike-in1.3. CPM1.4....[作者空间]
![[干货分享] 又一个碉堡的RNA-seq数据分析神器，分析不求人](https://img.haomeiwen.com/is15721061/ab3b0fe641eae934.png)
作者：白介素2 这是最好的时代，这也是最坏的时代；这是一个高通量技术蓬勃发展的时代，这也是小实验没钱做不起的时代这...[作者空间]
刘小泽写于19.2.9转录本定量一般有两种方式，一个是基于比对定量（如RSEM、eXpress）；另一种是不基于比...[作者空间]
序列比对和序列特征分析总目录 阅读框Open Reading Frame，ORF ORF指的是DNA上的序列，从5...[作者空间]
1.安装软件配置环境 先安装conda，相当于先给我们的电脑安装一个软件管家安装conda的方法 回车后系统会自动...[作者空间]
