国际惯例先上图 再放链接:Gitee repo - ShawnMagic / ShawnTBPluginR[htt...[作者空间]
在做单细胞转录组数据分析的时候,获得分群后我们希望知道每个群的marker基因是什么以此来描述细胞群的特征。其技术...[作者空间]
WGCNA分析教程,转自生信技能树分享WGCNA的实战细节: 一文看懂WGCNA 分析(2019更新版) 通过WG...[作者空间]
前面由于对miRNA的探针数目没有正确的理解,以为数据一直没有下载完全,折腾了一番。后来经老大jimmy提醒了,m...[作者空间]
前面已经在老大jimmy的帮助下,知道我下载的表达矩阵是没有问题的,那么我就直接往下做好了,不过在读取id转换的文...[作者空间]
想要复现一篇WGCNA文章中的原图,数据集时GSE85589,前面在下载数据时折腾了好久,原因是呢,我下载的矩阵的...[作者空间]
前些天老大布置了WGCNA的作业:下载GSE106292 数据集的 Excel表格如何读入R里面,做出作者文章中那...[作者空间]
Nov 21, 2019更新 => 修正部分function代码,实现了导出gene2module 目的 最...[作者空间]
任务驱使,直接看代码不明白是在干嘛。所以找了基因课的WGCNA课程来看,链接:http://genek.tv/,本...[作者空间]
I. Network analysis of liver expression data from female ...[作者空间]
WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module),并探索基因网络与关注...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! 本文采用WGCNA官网的Tutirial 1的数据,对加权基因共表达网络分析和后续的数...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! 识别到与表型数据相关的modules之后,还可以在该modules中进一步筛选基因,为...[作者空间]
刘小泽写于18.10.24最近开始写第一篇英文小论文,练练手,为将来写英文大论文做准备 目录 1 背景 Backg...[作者空间]
第23周 2018 — 10.21-10.27 原文链接: Application of weighted gen...[作者空间]
刘小泽写于18.10.14 跟着cyto导游继续探索网络世界昨天看了cyto的基本使用,那么你有没有想为什么会开...[作者空间]
刘小泽写于18.10.10很早就见过它,但只是不明觉厉,直到昨天才开始认真了解是这样的:昨天上午看了一篇文献,讲冠...[作者空间]
WGCNA的理论背景知识WGCNA的详细分析流程关键模块和hub基因筛选,在流程中并不可知模块划分好后如何找到ke...[作者空间]
WGCNA是一种从大量数据中挖掘module的算法,而这些module所包含的gene为一组表达模式类似或这说表达...[作者空间]
看这个之前,可以先看WGCNA的一些理论背景知识看完整个之后可以去看WGCNA关键模块和hub基因筛选 相似的表达...[作者空间]