CT图像肺结节识别算法调研 — CNN篇

作者: zhwhong | 来源:发表于2016-12-30 12:00 被阅读680次

深度学习方法


  • 单图识别

方法简介

类同于MINST图像的识别,将CT图像分解为64x64大小的图像,根据医生标注,若图像块中包含结节的中心点(centroid),则认为有结节,否则就没有。

Model

单图识别
  • Input layer:

64x64 images
标准化,取值范围0~1。原始图像的范围为 -1024 ~ 3072(有超出部分则取值为3072)

  • Layer 1:5x5 convolutional:

2x2 max pooling
24 feature map

  • Layer 2:3x3 convolutional:

2x2 max pooling
32 feature map

  • Layer 3:3x3 convolutional:

2x2 max pooling
48 feature map

  • Output layer, full connected:

16 neurons input
2 neurons output

  • 多图识别

方法简介

对于肺结节的识别来说,结节在单张CT图像中是一个圆形,而真实世界中,结节可以认为是三维立体的类球体,所以如果可以用三维图形来识别,应该会提高识别的准确率。

Model

多图识别

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网友评论

  • 2e027c5eb9d3:博主您好,我在运行你的代码时候报错tensorflow.python.framework.errors_impl.NotFoundError: utils/hungarian/hungarian.so: undefined symbol: _ZNK10tensorflow11TensorShape9dim_sizesEv
    这是需要什么环境配置吗?
    2e027c5eb9d3:@zhwhong 恩恩,是的,在想了好一阵子之后,确实发现原来是版本问题。。重新编译可以了。但是。。。又出现了IOError: [Errno 2] No such file or directory: '/haplox/users/wuhm/fjj/CT/lidc_nodule_detection/CNN_LSTM/data/lung_data/./lung_data/LIDC-IDRI-0188.dat_31_.bmp'
    这样的问题。。然后我在json文件里找到了这条路径,可是怎么找.bmp在哪?我回溯到lung_train.txt,这个文件怎么生成的啊?怎样处理生成得到.bmp文件呢?
    问题有点多,实在新手一枚,打扰啦:joy: ,谢谢博主耐心解答~
    zhwhong:额,这个难道是tf版本的原因,你自己重新编译一下hungarian,如果还是不行那就不太清楚了额,我当时用的时候tf版本还比较低
  • d42cb7a01be7:博主可以分享一下代码吗
    zhwhong:https://github.com/zhwhong/lidc_nodule_detection

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