上次介绍了一个可以查基因在癌症组织中表达差异的网站，GEPIA https://www.jianshu.com/p/b7b553107be5
这回介绍一个可以查基因在不同细胞系中表达差异的网站，The human protein atlas https://www.proteinatlas.org
打开之后，页面是这样的
输入我们感兴趣的基因，以CS36为例
在右上角选cell
下拉，就可以看到基因在细胞系中的表达情况了
image.png
上次介绍了一个可以查基因在癌症组织中表达差异的网站，GEPIA https://www.jianshu.com/p/b7b553107be5
这回介绍一个可以查基因在不同细胞系中表达差异的网站，The human protein atlas https://www.proteinatlas.org
打开之后，页面是这样的
输入我们感兴趣的基因，以CS36为例
在右上角选cell
下拉，就可以看到基因在细胞系中的表达情况了
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上次介绍了一个可以查基因在癌症组织中表达差异的网站，GEPIA https://www.jianshu.com/p...
CCLE数据库可以下载细胞系表达数据，可视化需要使用DepMap[https://depmap.org/porta...
经常遇到‘一个循环绘制每一个差异基因在肿瘤和正常的表达差异’和‘需要在一张图中展示多个差异基因在肿瘤和正常组的表达...
差异表达分析中通常需要利用箱线图或者小提琴图来对几组具有差异的表达值进行可视化表示。 同时，基于T.test, w...
最近实在太忙了，好久没有更新我们的简书了，今天抽空无论如何也要更新。 示例：查询PDCD1在各个泛癌细胞系中表达情...
研究思路 探究circRNA的第一步：找寻circRNA 首先是寻找差异表达的circRNA。通过微阵列分析细胞系...
做实验的时候，如果想说清楚靶分子的重要性，常规操作就是在表达量低的细胞系中过表达基因，在表达量高的细胞系中敲减靶分...
单细胞分群后，想看某些基因在不同cluster中的平均表达值，以及表达这些基因的细胞在不同cluster的占比...
如果我们想看某基因在某癌症中表达量变化，就不需要费那么大劲清洗数据了，直接找一个好用的可视化网站就可以了。GEPI...
先准备数据（有差异表达基因和上下调关系） 将差异表达基因粘贴到STRING网站[https://string-db...
本文标题：可视化网站-基因在不同细胞系中表达差异
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/hedlbqtx.html
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