话不多说，直接上解决办法
vim houxuan.txt
1 1 10000 #用TAB分割
1 10001 90000
bcftools filter 1000Genomes.vcf.gz -R houxuan.txt > 2.vcf
话不多说，直接上解决办法
vim houxuan.txt
1 1 10000 #用TAB分割
1 10001 90000
bcftools filter 1000Genomes.vcf.gz -R houxuan.txt > 2.vcf
话不多说，直接上解决办法 vimhouxuan.txt 1110000 #用TAB分割 1100019000...
首先制作bed格式的文件包含基因组全部的外显子区域坐标如下： 从vcf文件中提取位于exon区域的变异位点
根据id提取vcf（提取重测序数据不会有日志等啰嗦行） 根据染色体提取vcf 根据位置提取vcf（pos文件含染色...
变异注释发生在变异提取之后，获取VCF（Variant Call Format,VCF)文件后，目前从下机数据比较...
使用bcftoolsquery -ltest.vcf > 453.list 将vcf文件中的样品名提取出来 使用s...
提取染色体片段 提取文件中的某几列 根据位置提取vcf文件对应位点的信息 提取某一列数值满足条件的列 提取某些样本...
测序得到VCF文件后，有时需要提取部分SNP位点，这里介绍的工具是VCFtools，安装以及基础功能见下贴：vcf...
问题背景： 做GWAS分析，对方只提供了具有SNP和indel的vcf文件，需要提取SNP时，提取时去发现，需要对...
现在有syri生成的vcf变异文件分布在每个文件夹里，提取每条染色体的变异数目。 脚本： 使用a.txt 画图，将...
目标： 根据下载的GTF文件，利用bedtools提取基因组的不同区域。 实例： 见参考的网站 参考： 1、htt...
本文标题：提取目标区域的vcf文件
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/qriipktx.html
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