泛基因组学

作者: 一口亅 | 来源:发表于2020-12-23 17:49 被阅读0次

定义

泛基因组表示一个物种全部基因组成,是该物种所有菌株的基因库,它主要由三部分组成:核心基因、非必需基因以及菌株特有基因

特征

开放泛基因组和闭合泛基因组
泛基因组特征开放或者闭合反映了该物在基因组成上的多样性程度,同时体现了该物种的生长环境多样性以及该物种与外界进行遗传物质交流的能力

意义

  • 核心基因是指在该物种全部菌株中都存在的基因。一般地来说核心基因主要负责基本生物学功能以及该物种主要表型特征
  • 非必需基因和菌株特有基因都不是微生物生命活动必须的,主要编码次级代谢途径相关基因以及非细菌生长所必需的,但能够增加其生存优势的基因
  • 泛基因组学可以研究细菌的致病性、抗药性、宿主特异性、演化和环境适应性等

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