人种学自1725年萌发至今不到300年，学者们对世界人种的分类众说纷纭，莫衷一是。现今，大部分人类学家认同把人类分为三大种族：蒙古人种（亦称亚美人种或黄色人种）、赤道人种（亦称尼格罗-澳大利亚人种，俗称黑色人种）、欧罗巴人种（亦称欧亚人种或高加索人种，俗称白色人种）。其中每个大种中又延分为类型集团，再分为类型等，可谓纷繁复杂。现在的中国人基本上属于蒙古人种，其又分为三个种族类型集团：北亚人种（北亚种族类型）、远东人种（东亚人种或北方蒙古人种）、南亚人种（南方蒙古人种）；少数为欧罗巴人种，其又分为印度地中海人种和白波罗的海人种.
如今天新疆塔吉克族属于前者，俄罗斯族（已是二、三代为多，因此这里仅指俄罗斯人血统占多数者）属于后者。今天新疆其他11个世居民族，都属于蒙古人种，其中维吾尔、哈萨克、蒙古、柯尔克孜、满、锡伯、达斡尔、乌孜别克、塔塔尔等族属于北亚人种的中亚类型，与中亚主体民族一样，都是高加索人与东亚人的混血；而汉、回等族主要是东亚人种的华北型，其次是南亚人种的华南型。
然而，新疆远古居民的人种情况却不同。虽然目前从古人类学上未能全面阐明今天新疆境内的古代人种和种族问题，但据今已有的和田地区、罗布泊地区、天山东段南麓哈密地区和伊犁地区的考古学和人类学资料，可以肯定新疆的原始居民存在西方和东方两大人种支系成分。
目前对古代人种的鉴定，主要是通过对人骨材料，特别是对头骨的测量。根据新疆及其周边多年考古资料研究和分析，“西域史前文化的人种，成分是比较复杂多样的，既有欧罗巴人种，也有蒙古利亚人种，同时还有欧罗巴人种与蒙古利亚人种的混合杂型。从总体情况看，欧罗巴人种占主要优势，而欧罗巴人种中，又有许多不同的类型”。据此可以肯定的是，新疆大地的原始居民的祖先多来自西方。曾经轰动一时的“楼兰美女”，便是距今约3800年的这类白种人。
到距今3000—2000年时，由东方，特别是东北方的蒙古高原和东方的中原大地、河西走廊及青藏高原，不断有部族西迁至新疆。自此，新疆的人种成分开始大量增加东方人种。
通过已有的研究和考证，对新疆的人种也可以大致这样描述：新疆远古时期，在距今4000—2000年，以白种人血统居民为多。若按照中国著名考古和人类学研究者韩康信先生的观点，或可以这样表述：那时就新疆人种的成分而言，白种人多，而黄种人少。就人种分布及数量而言，东疆哈密、吐鲁番及南疆东部地区黄种人分布较广，但人口较少，南疆中、西部地区及伊犁河流域白种人较多。
从距今大约2000年开始，新疆黄种人血统居民逐渐增多，到以黄白人种的混合型占据主要地位，又逐渐形成黄种人成分居多的蒙古人种格局。
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