一、scMetabolism的安装 scMetabolism是一个R包,用于在单细胞分辨率下量化代谢活性,目前只适...[作者空间]
1. 数据和基因集准备 数据准备 基因集准备 使用AverageExpression函数提取分组平均表达矩阵 2....[作者空间]
生存模型的构建方法包括:1. Lasso回归;2. Cox多因素回归;3. 随机森林;4. 支持向量机 可以把lo...[作者空间]
在读张泽民老师发表的新冠文献的时候看到计算免疫细胞的cytokine score或inflammatory sco...[作者空间]
SCENIC官网:https://rawcdn.githack.com/aertslab/SCENIC/701cc...[作者空间]
示例数据:GSE139324有63个samples。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ge...[作者空间]
前言 我们知道,细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用,另一个通过细胞产生的可溶性小分子,即细胞因子。在...[作者空间]
Seurat Weekly NO.0 || 开刊词Seurat Weekly NO.1 || 到底分多少个群是合适...[作者空间]
什么是桑基图 桑基图(Sankey diagram),即桑基能量分流图,也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程...[作者空间]
关于拟时分析的一些基本知识请参看以下两篇及其参考文章: scRNA-seq拟时分析 || Monocle2 踩坑教...[作者空间]