传送门: RNAseq005 转录组入门(5):序列比对RNAseq004 转录组入门(4):参考基因组下载RNA...[作者空间]
1 比对的目的 1.1 差异表达基因只需要确定不同的read计数,可以用bowtie, bwa这类比对工具,或者是...[作者空间]
1 参考基因组 以下内容主要参考jimmy大佬的生信技能树及生信菜鸟团公众号 1.1 【直播】我的基因组(五):测...[作者空间]
1 基础了解 NGS008 测序常用名词NGS009 生信常用数据格式NGS010 测序数据质控 2 fasta与...[作者空间]
1 获取文章数据 1.1 获得文章数据地址 AKAP95 regulates splicing through s...[作者空间]
主要参考生信技能树RNA-seq基础入门 http://www.biotrainee.com/thread-175...[作者空间]
1 背景介绍 1.1 发展历程 全球单细胞测序技术研发从 2009 年开始起步,里程碑事件是汤富酬教授发表了世界第...[作者空间]
第一部分详见: NGS015 单细胞测序(上) 3 单细胞平台介绍 3.1 Missionbio Tapest...[作者空间]
1.单端测序 数据量=reads长度 × reads个数 2.双端测序 数据量=单端reads长度 × 单端rea...[作者空间]
二代测序的数据分析通常分为初级分析、次级分析和高级分析三个层次。以Illumina测序平台为例,讨论二代测序的图象...[作者空间]
1.微卫星不稳定性(MSI) 1.1 微卫星序列MS序列,是一些短而重复的DNA序列,串联重复排列,又称短串联重复...[作者空间]
1.框架图 2.白细胞 白细胞(leukocyte,white blood cell,简称WBC) 无色、球形、有...[作者空间]
CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromic ...[作者空间]
转座因子 Transposon 一段DNA顺序可以从原位上单独复制或断裂下来,环化后插入另一位点,并对其后的基因起...[作者空间]
靶向测序是将感兴趣的基因组区域通过捕获试剂盒进行富集后进行测序的研究策略,根据不同的应用,利用较少的数据量就能得到...[作者空间]
Total data/reads:总数据量/总reads数目 Q30:碱基测序质量值,Q=-10logP,P为碱基...[作者空间]
Fasta & Fastq Fastaa也即alignment,Fasta格式也称为Pearson格式,是一种基于...[作者空间]
1. 高通量测序技术(High-throughput sequencing) 高通量测序技术(High-throu...[作者空间]