你一定遇到过打开文件是乱码的情况,98%的时间里编码对我们来说并不重要,但是总有2%的时候由于编码问题导致了错误,...[作者空间]
生物信息学的分析需要强大的计算能力,有时采用算力强大的服务器才能满足我们的需求。ssh命令是最常用的远程登陆命令,...[作者空间]
上文提到的提高科学研究鲁棒性建议[https://www.jianshu.com/p/e7e5e4c9bbb5]已...[作者空间]
创造有可重复与鲁棒性的数据分析习惯不仅关乎个人的科学素养,并且使得我们的科研道路更加轻松。[http://doi....[作者空间]
在前一篇读书笔记中我们已经强调了数据分析鲁棒性与可重复性差的原因[https://www.jianshu.com/...[作者空间]
生物信息学家的工作是通过一系列专业的技能与工具来通过大量数据得到深刻的生物学理解。 自从08年第二代测序技术的出现...[作者空间]
欢迎来到"bio生物信息"的世界 BMC Bioinformatics前几天发布了一个画曼哈顿图的工具Manhat...[作者空间]
背景 我需要从约20个聚类的结果文件里面寻找到每个聚类的Marker基因,并且进行去重 然后对这些基因进行注释库搜...[作者空间]
欢迎关注微信公众号“bio生物信息” GeneATLAS的数据全部来自 UK Biobank 的452,264个英...[作者空间]
前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析(GWAS)原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得,做这个分析,先从跑...[作者空间]
一、数据来源 SRA数据库: Sequence Read Archive:隶属NCBI (National Cen...[作者空间]
对于解压多个.gz文件的,用此命令:for gz in *.gz; do gunzip $gz; done 对于解...[作者空间]
Mac的命令行sed出现以下错误: mac sed -e : extra characters after \ a...[作者空间]
引入 尽管科学界普遍同意,可重复再现是评估数据分析的最低标准,但是由于缺乏对数据的整理,对代码工具使用版本的记录等...[作者空间]
CNVs(copy number variations)是除了SNVs、INDELs之外另一种可能导致孟德尔遗传疾...[作者空间]
ANNOVAR的程序模块(本人目录) PS: 上述有些程序来自于很早以前的收藏,还有两个来自于网上和自写; con...[作者空间]
最近工作中遇到需要比对两个不同的VCF文件,看看两个VCF文件中哪些变异位点是相同的,哪些是不同的。为了寻找解决办...[作者空间]
目前GWAS方向发了很多文献,但是并没有一个很完善的R包对这些文献的数据进行汇总。 接下来推荐的这个是最新发表的G...[作者空间]
今天给大家带来国际上生信人寻找下一站常用的一些资源。小编旅居海外多年,投简历上百,阅广告无数,积累下丰富战斗经验,...[作者空间]
本文首发于微信公众号:Eman迩文基因(ID:emangene) 在河北省张家口市,刚过完一岁生日的果果,在五个...[作者空间]