影响因子:8.7 关于单基因泛癌分析,我们已经介绍了很多。我们的客户也发了数篇7分+的文章,只不过由于保密的原因,...[作者空间]
不知为何官网对于软件结果的说明文件被删除掉了,还好有其他有心人保存了下来 原文在这:https://www.jia...[作者空间]
发表杂志:Biological Procedures Online 影响因子:7.71 生信分析咨询 请关注“生信...[作者空间]
适用背景 在单细胞分析中,必要的一步是对每个细胞进行注释,这相当于给每个细胞打个标签,或者说起个别名,这些信息都存...[作者空间]
今天又是入门单细胞分析的一天在单细胞分析当中,我们会用到两个函数:NormalizeData()和ScaleDat...[作者空间]
CellChat 三部曲2:使用CellChat 对多个数据集细胞通讯进行比较分析 加载所需的包[#load-th...[作者空间]
对应原版教程第15、16章http://bioconductor.org/books/release/OSCA/o...[作者空间]
Seurat是分析单细胞数据一个非常好用的包,自带非常优秀的绘图函数,见Seurat绘图函数总结[https://...[作者空间]
关于什么是“拟时序分析”,可以参考本期推送的另一篇推文。这一篇直接演示代码 monocle2这个软件用得太多了,很...[作者空间]
主要根据文献中的描述与方法 髓系细胞分类 巨噬细胞,单核细胞,DC细胞 文献一:Single-cell lands...[作者空间]
1.FeaturePlot函数 FeaturePlot使用了split函数之后就没有legend了这个问题之前困扰...[作者空间]
Seurat官网:https://satijalab.org/seurat/articles/conversion...[作者空间]
常用的细胞通讯软件:CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5...[作者空间]
10x平台的双细胞率(符合泊松分布1): 根据Poisson分布,单个液滴包含超过一个细胞(doublets或mu...[作者空间]
前言,今天刚好在群里看到有人问“请问10X一个样本测多少个G比较好”,群主给出了答复,但是我对300这个数怎么来的...[作者空间]
轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p...[作者空间]
20210305 16:36最近在处理single cell 数据,老板要求用DESeq2跑差异基因,Seurat...[作者空间]
基因克隆(gene cloning)或分子克隆,又称为重组DNA技术,是应用酶学方法,在体外将不同来源的D...[作者空间]
本文是参考学习CNS图表复现04—单细胞聚类分群的resolution参数问题[https://mp.weixin...[作者空间]
高通量单细胞RNA测序现已广泛地应用到了各个领域当中,包括了解不同组织类型、疾病状态和不同时期样本中包含的多种细胞...[作者空间]