WES测序分析:fastq(bwa)bam(samtools+bcftools)vcf RNA-Seq测序分析:f...[作者空间]
今天想看一下自己的序列里面会不会有某细菌基因组存在,主要使用BWA和Samtools: bwa主要用于将低差异度的...[作者空间]
今天找计算测序覆盖度的时候发现了这个工具,github 主页是https://github.com/bioconv...[作者空间]
FastQC FastQC 是一个基于Java写的测序数据质量评估软件。因为是用跨平台的语言Java写的,自然而然...[作者空间]
转录组测序的最直接目的,就是设法寻找组间显著表达变化的基因,解释基因表达水平的变化对生物功能的影响。例如,肿瘤患者...[作者空间]
基于转录组测序获得的定量表达值,识别差异表达变化的基因或其它非编码RNA分子,实际上方法还是非常多的。但就目前来看...[作者空间]
【生信技能树】转录组测序数据分析 视频地址转录组测序数据分析[https://www.bilibili.com/v...[作者空间]
1、fastq文件 一般我们从公司里得到的原始测序数据都是属于fastq.gz文件, .gz是一种压缩格式的缩写,...[作者空间]
引言: 随着NGS测序成本的降低,高通量测序分析变得越来越普遍。然而,在实际工作中,生信人员往往拿到测序公司提供的...[作者空间]
处理数据时,需用到小鼠的基因组,于是在UCSC上面下载了小鼠的mm10基因组,但是是2bit格式,无fa文件, 不...[作者空间]
参考基因组和注释文件 Posted on 2018-06-30 21:27 微凉charles 阅读(1240) ...[作者空间]
Cutadapt安装 基本命令 例子: 常用参数 参数详解 Removing adapters Adapter 移...[作者空间]
之前分析过的测序数据,数据质量都很好,给了我一个错觉质控的前后差别不是很大,内心里对质控这一步也就不是很重视,跑完...[作者空间]