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    • 宏基因组下游分析
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      2023-01-27
    • 宏基因组下游分析[作者空间]

    • 生信分析中 功能注释常用数据库下载地址 --- 持续更新
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      2023-01-18
    • 生信分析中 功能注释常用数据库下载地址 --- 持续更新更新于: 2023-01-18 多线程下载工具axel的安装和使用 Uniref90 : Diamond 数据库格...[作者空间]

    • 2022-09-19
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      2022-09-19
    • 2022-09-19算法简介 线性回归模型(Linear Regression),因为结构简单,可解释性好,实现简单,在工程领域得到广...[作者空间]

    • 机器学习模型交叉验证脚本
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      2022-09-19
    • 机器学习模型交叉验证脚本机器学习模型交叉验证脚本 本文以阿里云机器学习平台上的 ps_smart (GBDT)算法为例,提供一个搜索最佳超...[作者空间]

    • MetaPhlAn4 Meta taxon
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      2022-09-14
    • MetaPhlAn4 Meta taxonGithub: https://github.com/biobakery/MetaPhlAn/wiki/MetaP...[作者空间]

    • 线粒体组装
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      2022-08-11
    • 线粒体组装1.下载线粒体参考序列 2.构建索引文件 参考Hisat2, Bowtie, Bowtie2和BWA构建基因组索引...[作者空间]

    • 正则化,归一化,标准化的区别与联系
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      2022-07-19
    • 正则化,归一化,标准化的区别与联系首先,标准化的英文是Standardization,归一化的英文是Normalization,正则化的英文是Reg...[作者空间]

    • 国内anaconda镜像站点汇总(2022-04-17更新)
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      2022-04-18
    • 国内anaconda镜像站点汇总(2022-04-17更新)添加镜像的命令 在国内使用 conda 镜像的时候最好删除一下~/.condarc 里的 defaults 频道。...[作者空间]

    • 利用MicrobiotaProcess完成LEFse分析(近似)
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      2021-12-15
    • 利用MicrobiotaProcess完成LEFse分析(近似)对于Lefse来说,首先测试所有特征在不同类中的值是否存在差异分布。其次,对显著不同的特征进行事后检验,不同类中子...[作者空间]

    • ggplot2优雅的绘制火山图
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      2021-09-07
    • ggplot2优雅的绘制火山图关于火山图,绘制的教程有很多也有不少专门绘制火山图的包,说到底火山图无非就是散点图的变形,本节来介绍如何通过ggp...[作者空间]

    • 单细胞转录调控网络分析工具(TF,motifs)-SCENIC
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      2021-06-01
    • 单细胞转录调控网络分析工具(TF,motifs)-SCENIC相信很多专题应该已经讲过SCENIC的使用,这儿,针对我自己对SCENIC的学习使用,遇到的问题做一个详细的讲解说...[作者空间]

    • 绘制堆叠柱形图(ggplot 2)使用群落微生物物种丰度表数据
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      2021-05-25
    • 绘制堆叠柱形图(ggplot 2)使用群落微生物物种丰度表数据群落微生物物种丰度表-绘制堆叠柱形图(ggplot 2) 今天我们先来讲一下如何利用细菌群落的高通量测序数据来绘制...[作者空间]

    • Q:功能基因组学?
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      2021-04-11
    • Q:功能基因组学?功能基因组学(Functional genomics)是对基因组中基因与基因间区域如何参与不同生物学过程的研究。在...[作者空间]

    • Kneaddata, Fastqc, Trimmomatic,
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      2021-02-04
    • Kneaddata, Fastqc, Trimmomatic, kneaddata的下载,安装,使用:宏转录组分析:kneaddata质控、SortMeRNA去rRNA[http...[作者空间]

    • 宏基因组学是什么?16S 测序和宏基因组测序分析有哪些?
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      2021-01-27
    • 宏基因组学是什么?16S 测序和宏基因组测序分析有哪些?宏基因组学 宏基因组学[https://baike.baidu.com/item/%E5%9F%BA%E5%9B%...[作者空间]

    • kneaddata安装及使用
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      2021-03-31
    • kneaddata安装及使用简介【注意】HUMAnN和MetaPhlAn分析前需要对下机数据进行质控。【注意】HUMAnN和MetaPhlAn...[作者空间]

    • 跟着Nature microbiology学画图~R语言ggpl
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      2021-01-07
    • 跟着Nature microbiology学画图~R语言ggpl前天的推文里模仿论文中的散点图以原点为中心花了一个坐标轴,R语言的ggplot2画图通常坐标轴是在左下角,如果想把...[作者空间]

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    • 基因家族鉴定流程(二) 用blast、mmseqs、diamon本文章将介绍 ①类blast软件blast、mmseqs、diamond、hmmer的比较 ②blast、mmse...[作者空间]

    • R语言实现bootstrap和jackknife检验方法
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      2020-12-19
    • R语言实现bootstrap和jackknife检验方法写在最前面:首先需要说一下,本文的bootstrap和jackknife都算是蒙特卡罗方法(Monte Carlo...[作者空间]

    • R批量下载B细胞和T细胞受体VDJ序列文件
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      2020-12-16
    • R批量下载B细胞和T细胞受体VDJ序列文件前面我们简单的介绍过免疫组库[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp...[作者空间]

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