更新于： 2023-01-18 多线程下载工具axel的安装和使用 Uniref90 : Diamond 数据库格...[作者空间]
算法简介 线性回归模型(Linear Regression)，因为结构简单，可解释性好，实现简单，在工程领域得到广...[作者空间]
机器学习模型交叉验证脚本 本文以阿里云机器学习平台上的 ps_smart （GBDT）算法为例，提供一个搜索最佳超...[作者空间]
Github: https://github.com/biobakery/MetaPhlAn/wiki/MetaP...[作者空间]
1.下载线粒体参考序列 2.构建索引文件 参考Hisat2, Bowtie, Bowtie2和BWA构建基因组索引...[作者空间]
首先，标准化的英文是Standardization，归一化的英文是Normalization，正则化的英文是Reg...[作者空间]
对于Lefse来说，首先测试所有特征在不同类中的值是否存在差异分布。其次，对显著不同的特征进行事后检验，不同类中子...[作者空间]
关于火山图，绘制的教程有很多也有不少专门绘制火山图的包，说到底火山图无非就是散点图的变形，本节来介绍如何通过ggp...[作者空间]
相信很多专题应该已经讲过SCENIC的使用，这儿，针对我自己对SCENIC的学习使用，遇到的问题做一个详细的讲解说...[作者空间]
群落微生物物种丰度表-绘制堆叠柱形图（ggplot 2） 今天我们先来讲一下如何利用细菌群落的高通量测序数据来绘制...[作者空间]
功能基因组学（Functional genomics）是对基因组中基因与基因间区域如何参与不同生物学过程的研究。在...[作者空间]
kneaddata的下载，安装，使用：宏转录组分析：kneaddata质控、SortMeRNA去rRNA[http...[作者空间]
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简介【注意】HUMAnN和MetaPhlAn分析前需要对下机数据进行质控。【注意】HUMAnN和MetaPhlAn...[作者空间]
前天的推文里模仿论文中的散点图以原点为中心花了一个坐标轴，R语言的ggplot2画图通常坐标轴是在左下角，如果想把...[作者空间]
本文章将介绍 ①类blast软件blast、mmseqs、diamond、hmmer的比较 ②blast、mmse...[作者空间]
写在最前面：首先需要说一下，本文的bootstrap和jackknife都算是蒙特卡罗方法(Monte Carlo...[作者空间]
前面我们简单的介绍过免疫组库[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp...[作者空间]
