R语言绘图包系列: R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.c...[作者空间]
单细胞转录组学已经改变了我们表征细胞状态的能力,但深入的生物学理解需要的不仅仅是一个clusters的分类列表。随...[作者空间]
GSVA 也是 SCI 文章中常见的分析方法,在我们获得多个pathway的时候,可以比较pathway在样本分组...[作者空间]
前面课程的代码见【生信技能树】R语言学习代码笔记 - 简书 (jianshu.com)[https://www.j...[作者空间]
这两天看用vcf文件做单倍型网络的内容,找到了一篇plos one上的论文 论文题目是 A workflow wi...[作者空间]
SingleR包可基于参考数据集,实现对单细胞数据细胞类型的自动注释。celldex包提供若干常用的人/老鼠的注释...[作者空间]
ORA富集分析只需要提供差异基因列表,GSEA富集分析还需要提供对应差异倍数信息。但二者都是基于差异分析得到的结果...[作者空间]
文献:High-grade serous tubo-ovarian cancer refined with sin...[作者空间]
DESeq2 multiple group comparison (biostars.org)[https://w...[作者空间]
写在前面 由于circos官网的教程太全面了,虽然好但反而感觉比较复杂,难易上手,因此我将他们精简了一下。由于官网...[作者空间]
轨迹函数 1. Ideograms 在前面的例子中,我们使用 circos.initializeWithIdeog...[作者空间]
前言 圆形可视化广泛应用于基因组及其相关的组学领域中,能够有效地展示高维基因组学数据。 在基因组数据中,通常是根据...[作者空间]
之前遇到这样一个绘图需求:能够展示一群细胞的两种分类方式的比例;我就联想到一种类似于两个饼状图叠加的方式展示(暂且...[作者空间]
很久没有跟新啦~~~忙着基金。。基金。。还是基金,然后就是文章。。文章。。还是文章。终于有空整理之前的东西。 说绘...[作者空间]
前段时间,使用ggplot2绘制饼图时,不停调整参数,图例,浪费许多时间。这几天刚好看到ggpubr包中有绘制饼图...[作者空间]
好久没有学习RNAseq的东西了,今天随意翻到一篇很不错的总结,这里了只是我的学习笔记,原文会更好一些:https...[作者空间]
出发点: 源自Single cell RNA sequencing to dissect the molecula...[作者空间]
参考: R语言第二章数据处理③删除重复数据果子学生信 1.保留第一个重复: A,A,B,C --->A,B,C2....[作者空间]