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不知觉间，距离我写下第一篇关于 WGS 数据分析系列的文章已经过去了三年多（WGS 系列文章[https://mp...[作者空间]

Mosdepth是一种用于快速计算全基因组测序覆盖率的命令行工具。它测量BAM或CRAM文件在基因组中每个核苷酸位...[作者空间]

ADMIXTURE 是常用的群体遗传学分析工具，可以估计个体的祖先成分。与 STRUCTURE 相比，它的速度更快...[作者空间]

单倍型，是单倍体[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%...[作者空间]

一、人类基因组有多大 参照UCSC提供的hg38版本，也是目前常用的人类参考基因组http://hgdownloa...[作者空间]

GATK4流程学习之背景知识与前期准备 - 简书[https://www.jianshu.com/p/97e803...[作者空间]

一、VCF格式背景 1、VCF的由来 VCF（Variant Call Format）格式是记录测序结果里相对于参...[作者空间]

第一步使用bwa将测序结果比对到参考基因组，获得sam格式文件 sam转换为bam并排序 统计测序深度用到的软件是...[作者空间]

The BED format is a concise and flexible way to represent...[作者空间]

GenomicFeatures包主要提供了TxDb对象结构。基于此对象的操作，we can easily down...[作者空间]

参考资料：https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/...[作者空间]

昨天看了gatk的官网，从2018年发布正式版的4.0.0开始，到现在已经更新到4.1.8，在速度和准确度上都有了...[作者空间]

偶然见发现了一R包，名曰vcfR，可高效处理vcf文件，并且可以做出好看的图片 具体可查看说明文档高铁直达 安装 ...[作者空间]

已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体，又如R包chromoMap，IdeoViz，karyploteR，...[作者空间]

Dragon star Day 3 Pt.1 关于结构变异、CNV Calling、SNP genotyping、...[作者空间]