什么是泛基因组? 2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘...[作者空间]
很早之前就觉得用DNAMAN做的多重比对导出来的图不是很好看了,而且后期还要进行PS或者PPT进行修饰。 因此,到...[作者空间]
我们需要提取下面的表格到本地,具体图片如下: 我们首先先点击表格右上角的JSON下载为JSON格式(假设保存的为d...[作者空间]
任务 差异基因分析这个步骤推荐在R里面做,载入表达矩阵,然后设置好分组信息,统一用DEseq2进行差异分析,当然也...[作者空间]
以Targeting super-enhancer-associated oncogenesin oesophag...[作者空间]
作业要求 在UCSC下载hg19参考基因组,从gencode数据库下载基因注释文件,并且用IGV去查看你感兴趣的基...[作者空间]
目前对于variant进行注释的软件主要有4个: Annovar, SnpEff, VEP(variant Ef...[作者空间]
参考原文:http://www.nature.com/ng/journal/v48/n10/full/ng.364...[作者空间]
在做有参测序分析的时候,选择准确合适的基因组是极其关键的,今天来看下人的参考基因组fasta文件包含哪几个部分. ...[作者空间]
网络爬虫(web crawler),也叫网络蜘蛛(spider),是一种用来自动浏览万维网的网络机器人。其目的一般...[作者空间]
本期解读NAR的一篇文献,NAR的影响因子每年都稳步上升,今年已经上了10,来看看这篇文献中的数据库构建思路。 药...[作者空间]
欢迎关注生信宝典,获取更好阅读体验。 http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5MT...[作者空间]
对差异表达基因表达谱数据进行深度挖掘,看如何做PPI(蛋白-蛋白相互作用)生信分析发个2-3分的文章。 文章标题及...[作者空间]
随着测序技术及质谱技术的不断发展,各种生物信息学分析工具和技术也随之而生,但种类繁多、安装麻烦、非图形界面的分析工...[作者空间]
Pymol可能不做分子模拟的同学也会比较熟悉,这个可视化界面可谓脍炙人口,虽然我们可以简单的使用sudo apt-...[作者空间]
当一个 NGS 项目中对同一个样本进行了 WGS 和 RNA-seq 测序,或者对同一个肿瘤患者的肿瘤组织和癌旁组...[作者空间]
前言 这次给大家带来的是16年发表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇处理RNA-seq数据的文章:Tra...[作者空间]
以前还真没注意回车和换行有啥区别,直到。。。 那天我在windows下使用notepad下编辑一个小文本,用not...[作者空间]
TCGA数据分析: TCGA基因/miRNA表达谱及临床数据下载TCGA基因/miRNA表达谱数据整合TCGA基因...[作者空间]
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