学习linux常用命令,并且实战ChIP-seq已经一个月了。现在需要用R包ChIPseeker进行注释,发现R已...[作者空间]
1.针对大基因组,缺乏高效、轻便的甲基化差异分析工具 methylKit(超内存,只能跑同数量较少的CG类型差异分...[作者空间]
今天要分享解读的是一篇发表于Leukemia(IF 11.528)的DNA甲基化研究文章,本文通过重亚硫酸盐扩增子...[作者空间]
前言 首先,对3个R包进行简单介绍。methylkit:用于高通量亚硫酸氢盐测序的DNA甲基化分析和注释的R包。该...[作者空间]
接复盘总结(一) methylkit R包上游处理 对甲基化位点进行注释、导出SPM分析上游文件 几点说明:1.启...[作者空间]
新年最适合干什么?当然是复盘总结!!先从代码开始复盘。 linux处理bed文件 用linux不多,还是一开始尝试...[作者空间]
文件格式 可以是最基本的甲基化调用文件也可以是bismark下游的BAM/SAM文件。 在这里使用的是经过处理得到...[作者空间]
引言 methylKit是一个R软件包,用于分析和注释通过高通量亚硫酸氢盐测序获得的DNA甲基化信息。该软件包旨在...[作者空间]