安装WGCNA 安装过程可能会不太顺利,大家可以自行查找解决方案。 导入表达数据 有很多基因是不表达或者表达了很低...[作者空间]
什么是WGCNA? WGCNA(Weighted Gene Co-Expression Network Analy...[作者空间]
写在前面 最近又是忙碌的一米,做不完的手术,收不完的病人,前途堪忧,收入更是不堪入目。? 把之前的WGCNA教程再...[作者空间]
引言 大家好,我是小杜。 从2022年开始关注的同学知道,“小的生信筆記”面对的对象是针对零基础的同学,尤其是自学...[作者空间]
关于WGCNA的分析,共有3期教程,今天是的第三期。前面两期是使用代码进行分析的,也是我们的平时最常用的分析方法,...[作者空间]
--关于WGNCA的教程,本次的共有三期教程,我们同时做了三个分析的比较,差异性相对还是比较大的,详情可看WGCN...[作者空间]
注意:今天的教程比较长,请规划好你的时间。本文是付费内容,在本文文末有本教程的全部的代码和示例数据。 输出结果 分...[作者空间]
加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis...[作者空间]
写在前面 前面我们用WGCNA分析完成了一系列的分析,聚类分割模块。? 随后进一步筛选,找到与我们感兴趣的表型或者...[作者空间]
写在前面 前面我们用WGCNA分析得到多个模块,其中有一些模块和我们感兴趣的表型或者临床特征是相关的。? 接着就是...[作者空间]
写在前面 之前我们完成了WGCNA输入数据的清洗,网络构建和模块识别。? 但这里我们的示例数据内所含有的基因其实是...[作者空间]
写在前面 上期我们完成了WGCNA输入数据的清洗,然后进行了样本的聚类与异常值的剔除,总体来说是非常简单的。 ?这...[作者空间]
写在前面 最近实在是忙的不行,根本没时间更新,一到家就只想睡觉。? 今天写个最近用到的分析方法,Weighted ...[作者空间]
前述,我们提起,王骁老铁开发了一个 TBtools-Rplugin。这个 Plugin 事实上是一个 R Shin...[作者空间]
WGCNA得到两个矩阵,一个是样本和epigene,另一个是样本和性状,也就是下面这两幅图 这两幅图有没有继续裂变...[作者空间]
参考资料链接 https://github.com/cxli233/SimpleTidy_GeneCoEx/tre...[作者空间]
前面给大家介绍了 ☞[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.we...[作者空间]
WGCNA全称weighted gene co-expression network analysis,即加权基因...[作者空间]
参考文献High-resolution spatiotemporal transcriptome mapping ...[作者空间]
前面一个WGCNA的学习我们主要学习了如何进行相关性的分析和module的鉴定,以及网络的输出,主要的代码如下: ...[作者空间]