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    • 判断GEO芯片数据表达矩阵是否需要log2转换
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      2019-05-27
    • 判断GEO芯片数据表达矩阵是否需要log2转换通过exprs函数获取表达矩阵后我们可以通过以下三种方法判断是否需要进行log2转换 1.肉眼识别 最简单粗暴的方...[作者空间]

    • 利用Kmeans聚类分析两类问题
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      2019-04-04
    • 利用Kmeans聚类分析两类问题聚类分析是一种无监督的学习方法,根据一定条件将相对同质的样本归到一个类总(俗话说人以类聚,物以群分)正式一点的:聚...[作者空间]

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      2019-02-17
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    • 为什么说FPKM和RPKM都错了?
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      2019-01-30
    • 为什么说FPKM和RPKM都错了?这本是三年多之前我发在公众号上的一篇旧文,一些偶然的机会,发现不少朋友也在讨论这个问题,因此我重新做了梳理并发出来...[作者空间]

    • RNA-seq中的那些统计学问题(一):为什么是负二项分布?
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      2019-01-01
    • RNA-seq中的那些统计学问题(一):为什么是负二项分布?1. 转录组数据统计推断的难题 在RNA-seq中进行两组间的差异分析是最正常不过的了。 我们在其它实验中同样会遇...[作者空间]

    • 关于readsCount、RPKM/FPKM、RPM、TPM的理
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      2018-09-12
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    • 当我们在说RNA-seq reads count标准化时,其实在
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      2018-08-06
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    • Read count CPM RPKM
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      2018-07-09
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    • RNA-seq的标准化方法罗列
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      2018-05-21
    • RNA-seq的标准化方法罗列RNA-seq的标准化方法 对于RNA-seq而言,由于 技术误差, 测序深度不同, 基因长度不同,为了能够比较不...[作者空间]

    • gene symbol 中的奇怪开头基因
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      2018-01-17
    • gene symbol 中的奇怪开头基因这本是我为论坛的基础板块写的一个 基础知识点,但是浏览量实在有限,不忍它蒙尘,特在博客重新发布一次! 原帖见:ht...[作者空间]

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