对于Lefse来说，首先测试所有特征在不同类中的值是否存在差异分布。其次，对显著不同的特征进行事后检验，不同类中子...[作者空间]
也做了挺多次RDA分析，自己现在小结一下RDA分析流程： 就我个人而言，虚线前面都是不太经历的步骤，我一般不会主动...[作者空间]
最近在进行lumicycle实验，接触到了细胞上面的衰减的昼夜节律。关于这一点，和动物造模有所不同，在细胞上面，由...[作者空间]
处理方法：常规方法 由mape（Mean absolute percentage error，平均绝对百分比误差）...[作者空间]
稳健PCA，就是一种通过构造稳健的均值向量和稳健的协方差矩阵的主成分分析方法，其目标是从输入矩阵中去除稀疏缺失并获...[作者空间]
老样子，跟着文档学习 1.readxl包：读取结果为tibble 1.正常读取：read_excel("test....[作者空间]
cosinor分析之前已经介绍过两个了（cosinor，cosinor2），其实R中还有三个包可以进行cosino...[作者空间]
最近突发奇想整理了一下R中做PCA的一些函数，不整不知道，一整吓一跳，R中原来做PCA和画图的函数竟然有如此之多，...[作者空间]
R中关于韦恩图和热图的画法有很多，但是比较流行的画法基本都不是基于ggplot2绘制的，而这个时候我们又想将其与g...[作者空间]
原先的y轴： 无下标，有粗体labs(y="RER (VCO2/VO2)") 后来： 有下标，无粗体，尝试更改...[作者空间]
相关包 图 主题 其他调整[作者空间]
想展示OTU和环境或样本的关系，但原始OTUs数目特别多，怎么办？先做差异分析，差异分析完在做RDA，但每个样本差...[作者空间]
最近从geo上下了一个比较大的甲基化数据集（GSE145361），idat文件一共有3778个（grn和red一一...[作者空间]
分层k-means聚类 The procedure is as follow: Compute hierarchi...[作者空间]
0.质控 1.建立亚硫酸盐基因组index 2. 比对 输出结果有两个重要文件，一个bismark_bt2_PE_...[作者空间]
Windows版本的R启动配置文件在R/etc/Rprofile.site文件中，用记事本打开即可[作者空间]
1.JTK 使用metacycle包进行JTK的分析，其实metacycle包中可选的分析方法有ARSER(Yan...[作者空间]
最近处理数据遇到了分数表示的字符串，希望其能变成小数，现找到如下一些解法例如，有如下分数字符串，要把它转变为小数 ...[作者空间]
R语言有大量的内置色彩供我们使用，具体可以使用colors()提取色彩名称，colors(F)不去重有657种，c...[作者空间]
