目的：DEseq2是基于负二项分布模型，寻找组间显著表达变化的基因，以解释基因表达水平的变化。 内容：1. 将样本...[作者空间]
本节概览1. WGCNA基本概念：定义、关键术语、基本流程、一些注意事项2. WGCNA运行：⓪输入数据准备①判断...[作者空间]
前面通过视频给大家讲解了☞[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp....[作者空间]
数据集 linux的代码 R语言代码 这个是升序来的 如果降序 如果排序只作用于某一列，可以直接在arrange(...[作者空间]
R包-ggtreeExtra绘制进化树 ggplot2提供的geom_tile图层可以画热图了，ggplot2的g...[作者空间]
论文是 Environmental factors shaping the gut microbiome in a...[作者空间]
写在前面绘制一个生物学研究中最普遍的图，误差线图+数据分布+显著性分析。 数据准备 自行编写一个数据集，无实际意义...[作者空间]
学习某些生物数据分析重要的R包时，极有可能第一步安装R包就被卡住。学习R的过程中也积累了很多R包安装不上的解决方法...[作者空间]
差异基因筛选的常见方法有edgeR, DEseq2, EBseq等，这篇文章主要介绍DEseq2。 官方网站：ht...[作者空间]
1、DESeq2差异表达分析 R语言数据类型：向量（vector）；列表（list）；矩阵（matrix）；数组（...[作者空间]
最广为人知的富集分析做法是把上调、下调基因分别或者合并，拿来做GO和KEGG富集分析。经常有一些数据集，拿差异基因...[作者空间]
一、PWM与PFM的介绍 motif指的是转录因子偏好结合的DNA序列模式或RNA结合蛋白偏好结合的序列模式，一般...[作者空间]
在twitter上看到一个图 配色很漂亮，代码和数据也是公开的，今天的推文来学习一下他的代码 代码来源的链接是 h...[作者空间]
背景 众所周知，excel生成的文件后缀是xls或者xlsx，早期读取这样的文件，要么就另存为csv格式，要么就用...[作者空间]
火山图（volcano plot）常用于显著差异基因表达的展示，包含显著和差异两个重要信息。显著性指P值小于0.0...[作者空间]
R语言 热图-组学分组数据+归一化 使用R语言对组学数据进行归一化并绘制热图 结果速览 需要软件环境 Window...[作者空间]
举个栗子 这是一组随机数，假如需要把这样的一组数字放在图里，是需要整齐统一的显示出来。基本上有两种思路，一是保留相...[作者空间]
今天继续 跟着Nature Communications学画图 系列最后一篇。学习R语言ggplot2包画箱线图。...[作者空间]
