单细胞分析不可避免的会涉及到鉴定不同细胞类型的功能或比较相同类型在不同状态下的功能差异，因此，功能分析在单细胞分析...[作者空间]
在Linux上跑GSEA只是工程需要，在Windows上不能批量的跑；在单细胞数据上跑GSEA那是客户的需要。有需...[作者空间]
2020.11.19 Cell Ranger更新到了5.0版本。官网的更新说明包括以下三个部分： 一、关于基因表达...[作者空间]
我所理解的cellranger软件理想原始输入数据就是SRA格式，然后利用sra-tools分为read、barc...[作者空间]
简要内容--拟时序分析的定义--结果解读--------做出结果（cluster、state）--------确定...[作者空间]
刘小泽写于2020.8.13主要分为两个部分：前面用linux处理，后面用R处理 下载数据 选用的10X测试数据是...[作者空间]
刘小泽写于2020.7.19为何取名叫“交响乐”？因为单细胞分析就像一个大乐团，需要各个流程的协同配合单细胞交响乐...[作者空间]
随着生物学背景知识的增加，单细胞图谱的可视化直接用10X的Loup或者seurat的Dimplot函数直接绘制的u...[作者空间]
这一篇文章是回答知识星球中一位星友的提问，她的电脑内存有限，无法直接使用所有数据，只能分析部分数据。 数据来源: ...[作者空间]
目前该软件只支持Mouse和Human，不支持其他物种，因此不是这两个物种的小伙伴可以不用看了。 scCATCH全...[作者空间]
入门必读：https://www.jianshu.com/p/85e2e38df673 Q1:有的群2个或者3个不...[作者空间]
单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：预处理与聚类 单细胞转录组数据分析|| scanpy教程：PAGA轨迹...[作者空间]
一、介绍 用于单细胞RNA-seq数据 提供严格的质量控制：将原始测序读数处理为可用于下游分析的高质量表达数据集 ...[作者空间]
刘小泽写于19.10.24笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索Smartseq2技术及发育相关的分析课程...[作者空间]
刘小泽写于19.10.24笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索Smartseq2技术及发育相关的分析课程...[作者空间]
刘小泽写于19.10.23笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索Smartseq2技术及发育相关的分析课程...[作者空间]
刘小泽写于19.10.15笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索10X Genomics技术相关的分析课程...[作者空间]
刘小泽写于19.10.14笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索10X Genomics技术相关的分析课程...[作者空间]
刘小泽写于19.10.14笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索10X Genomics技术相关的分析课程...[作者空间]
1 简介 1.1 scRNA-seq 2009年由汤富酬等人首次公开 测量每个基因在细胞群中表达水平的分布 允许研...[作者空间]
