关于该软件的计算可选参数以及结果文件的解读，见前三篇分享： 序列比对软件 MUMmer 快速上手（一）[https...[作者空间]
重复序列注释 “由于物种间重复序列的保守性相对较低，针对特定的物种进行重复序列的预测时需要构建特定的重复序列数据库...[作者空间]
首先是用gffread提取cds序列,蛋白序列,转录本序列 接下来我们利用组合工具来提取mRNA,和gene序列 ...[作者空间]
参考链接 https://bioinformatics.uconn.edu/genome-size-estimat...[作者空间]
EMMAX是关联分析速度提升的一个代表性算法, 已广泛应用于棉花、大豆和水稻等的复杂性状关联分析。EMMAX认为，...[作者空间]
PSMC软件分析群体历史有效群体大小流程 1 文件转换 基因组文件格式为.bam，callsnp之后，再转换为.f...[作者空间]
很多重复命令（如：建几万个基因树）用 for 循环串行太慢了，可以使用 ParaFly[http://parafl...[作者空间]
Synteny and Rearrangement Identifier (Syri), 鉴定基因组间SV。以全基...[作者空间]
写在前面从NCBI下载的注释文件通常是gbff格式的，而我们平时做上游分析用到的大多数为gff或gtf文件，那么这...[作者空间]
1、minimap2 Minimap2 is a fast sequence mapping and alignm...[作者空间]
在个人笔记本win10自带子linux系统下，运行基于CPU运算的RoseTTAFold 避开uniref30、B...[作者空间]
前言： AlphaFold2在CASP14蛋白质结构预测关键评估大赛中夺得第一名的好成绩，其预测的大部分结...[作者空间]
现在组装新基因组，一般用pacbio的hifi测序模式进行olc组装+Hi-c辅助组装染色体就行了，但是我们实验室...[作者空间]
1. 服务器集群 服务器集群就是指将很多服务器集中起来一起进行同一种服务，在客户端看来就像是只有一个服务器，集群可...[作者空间]
