单细胞rna测序(scRNA-seq)已被广泛应用于通过测量单个细胞的mRNA表达模式来发现新的细胞类型和重建发育...[作者空间]
subset函数，从某一个数据框中选择出符合某条件的数据或是相关的列（1）单条件查询 （2）指定显示列 （3）多条件查询[作者空间]
经常会遇到下载的基因表达数据，是分散在多个数据文件中，而我们为了得到基因表达矩阵，则必须要做的一步就是通过R语言合...[作者空间]
其实，虽然我已经上了10次线下课，但是这种表现多个数据交集的图，一直都不会画。 最主要的原因就是，从来没有这个需求...[作者空间]
简介 生物统计学是生物数学中最早形成的一大分支，它是在用统计学的原理和方法研究生物学的客观现象及问题的过程中形...[作者空间]
Seurat - Guided Clustering Tutorial Seurat，一个单细胞数据分析工具箱 十...[作者空间]
《R语言实战》这本书上是这样描述by()函数的： 使用by()分组计算描述性统计量，它可以一次返回若干个统计量。格...[作者空间]
Seurat简介 Seurat---几乎是当前单细胞RNA-seq分析领域的不可或缺的工具，特别是基于10X公...[作者空间]
Monocle可以进行下面三种类型的分析，可以与seurat无缝连接： 1 对细胞进行聚类、分组和计算；2.进行拟...[作者空间]
一.基本概念 "一张统计图形就是从数据到几何对象(geometric object, 缩写为geom, 包括点、线...[作者空间]
积跬步，至千里 1.介绍R语言及RStudio 1.1 安装R 包和Rstudio1.2Rstudio四个区块，区...[作者空间]
前言 最近在琢磨单细胞的分析包Seurat，其对象type是一个S4 object，value显示为S4 obje...[作者空间]
sample基本用法参数解释：x表示所要抽样数据，size表示抽样个数，replace为T表示采取有重复的抽样代码...[作者空间]
加载所需R包 设置工作路径 构建测试数据集 将热图结果按聚类后的顺序输出[作者空间]
样本间相关性评估 上一步得到各个样本的BAM文件之后，就可以在全基因组范围上看看这几个样本之间是否有差异。也就是先...[作者空间]
本次笔记内容：cor.test()和cor()rcorr() {Hmisc}corr.test() {psych}...[作者空间]
写在前面： R包都有自己的说明书（cheatsheet），俗称小抄。在对包有了一定的了解后，小抄是一个很好的学习操...[作者空间]
最近可能会用到圈图，学习一下用R语言的circlize包绘制圈图的方法，通过help（package="circl...[作者空间]
在使用ggplot2进行绘图之前，我们需要先把数据整理成规范的格式。在R语言入门中我们了解到，ggplot2只支持...[作者空间]
