通过前期的分析,我们确定了感兴趣的module,但是module中又含有几十甚至上百的基因,下一步需要进一步筛选h...[作者空间]
前言 对跨物种的RNA-seq进行标准化和差异分析已知是一个问题,而目前对此类问题的相关研究还比较少,有用RPKM...[作者空间]
[1]Anders S, Huber W. Differential expression analysis fo...[作者空间]
Introduction 除了利用ballgown流程,目前比较流行的方法还是通过序列比对和计数获得的计数矩阵,然...[作者空间]
stringtie官网[http://ccb.jhu.edu/software/stringtie/index.s...[作者空间]
很久没有跟新啦~~~忙着基金。。基金。。还是基金,然后就是文章。。文章。。还是文章。终于有空整理之前的东西。 说绘...[作者空间]
1 、fastp软件的安装 wget http://opengene.org/fastp/fastpchmod a...[作者空间]
一.样本表达分布 箱式图 小提琴图 概率密度分布图 以上三个图结合起来可以看总体样本表达分布图 二.样本的相关性 ...[作者空间]
写在前面:新手老菜鸟,个人心得,不足之处欢迎交流指正;写作不易,转载前请联系我征得同意,谢谢。 1.基本原理 1....[作者空间]
本篇代码参考文章:1.生信菜鸟团:一文学会WGCNA分析2.WGCNA(加权基因共表达网络分析)3.WGCNA分析...[作者空间]
刘小泽写于2018.8.20利用htseq-count、featureCounts等定量软件生成的counts计数...[作者空间]
WGCNA分析基于两个假设:1.相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路,2.基因网络符合无尺度分...[作者空间]