Hifiasm 使用教程 介绍 Hifiasm 是一个快速的单倍型解析 de novo 组装软件，最初设计用于 P...[作者空间]
pacbio三代全长转录组数据分析isoseq31 参考官方文档及其他教程，包括原理、流程等 2 软件安装主要参考...[作者空间]
NOVOPlasty是一个小型环状基因组的软件，这意味着这个软件可以组装线粒体基因组和叶绿体基因组。这个软件是一个...[作者空间]
今天的推文简单介绍一下使用GeOrganelle这款软件利用全基因组重测序数据组装叶绿体基因组的过程 现在做植物的...[作者空间]
NECAT 可用于ONT数据的纠错，组装，如果想对ONT long reads进行call SV，也可以使用nec...[作者空间]
前言：nanopore的下机数据是fast5格式，通常在下游分析之前，需要转换成fastq，poretools是一...[作者空间]
1.软件安装安装序列比对软件LAST 安装sam格式处理工具sambamba 安装bedtools 安装结构变异识...[作者空间]
前言：仍然是三代测序数据的分析，宏基因组的文章中经常出现聚类热图和物种丰度图，用来直观地识别与某些疾病或者表型相关...[作者空间]
之前那我由于需要对PacBio的组装结果进行polish，于是写了「三代组装」Pacbio组装后如何用自身数据进行...[作者空间]
前言：nanopolish是开源的综合性分析软件，集成了非常多的三代测序数据分析小工具。 1.软件安装：通过Git...[作者空间]
前言：第三代测序技术正在逐渐成熟。目前的测序读长可达150kbp左右。Nanopore公司的MinION测序仪，优...[作者空间]
一句话总结，组装深度建议高于30X，N50建议高于11Kb，否则会出现严重的片段化。 最初参加三代组装培训的时候，...[作者空间]
前言：ONT，即Oxford Nanopore Technologies，划时代的纳米孔测序技术。ONTrack是...[作者空间]
1 碱基识别工具Metrichor是ONT公司推出的基于隐马尔可夫模型进行碱基识别的软件。它的使用需要网络连接。M...[作者空间]
不废话直接上干货：https://long-read-tools.org/到目前2020年2月13日为止这个网站收...[作者空间]
wtdbg2优点是速度非常快，安装使用都非常简单。用于nanopore及pacbio数据的组装 原理 首先要注意，...[作者空间]
导读 SPAdes是2012年发表在Journal of Computational Biology上的一篇文章提...[作者空间]
应用单细胞测序技术研究科学问题越来越普遍，当下应用最火热的是10X Genomics公司的解决方案，但是在某些特殊...[作者空间]
一：下载安装 需要注意的是这个软件运行需要Python2的环境哦。然后安装好了记得加环境。这次用的是大肠杆菌的一个...[作者空间]
