针对测序数据和芯片数据,目前常用差异分析的R包有edgeR、limma、DESeq2,做一简单比较,方便平时分析。...[作者空间]
基因富集分析 (gene set enrichment analysis):在一组基因或蛋白中找到过表达的基因或蛋...[作者空间]
1. 两种基因功能富集方法介绍 名词解释:1. 基因功能富集分析:包括过表达分析ORA、功能分类打分FCS、基于同...[作者空间]
GSVA全名Gene set variation analysis(基因集变异分析),是一种非参数,无监督的算法。...[作者空间]
需求 1.快捷查找ID对应的description,知道通路对应的编号是多少。2.找出某一个/几个通路里的全部基因...[作者空间]
1 整理表格,使symbol转entrezid,利于后面的富集分析。 2 GO 分析 BP,MF and CC分别...[作者空间]
三大R包差异分析 可视化 三大R包差异基因对比 #########生信技能树课程笔记[作者空间]