R包文档参考:https://www.metaboanalyst.ca/docs/RTutorial.xhtml#...[作者空间]
在自然群体(区别于强人工选择)中,如果我们感兴趣的数量性状表现出与特定的地理环境变量有高度的关联性,随着环境变量的...[作者空间]
简介 主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是对变量数超过样本数量或变量之间存在多重共线性的组学数据进行可视...[作者空间]
简介 来自Identification of Metabolism-Associated Prostate Can...[作者空间]
你的组学数据都存在哪里?NCBI,EBI....除了这些你还可以选择国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)。 2...[作者空间]
做代谢组研究,你一定会用到它——HMDB 人类代谢组数据库(HMDB)于2007年首次发布,被认为是人类代谢研究的...[作者空间]
ChEMBL数据库是欧洲生物信息研究所(European Bioinformatics Institute,EBI...[作者空间]
安装 查看MALDIquant包带的数据 共有16个样本 标准化 减少峰的波动,克服方差均值的相互影响[作者空间]
snThres表示的是信噪比参数的设置,rtStep生成峰文件的步长由于这里用的是示例数据,如果是自己的数据那么d...[作者空间]
xcms用于LC-MS和GC-MS数据分析,用于色谱分离和单光谱质谱数据处理和可视化的框架。导入AIA / AND...[作者空间]
主要内容: 1.多组学数据整合概述 2.主要分析软件汇总 3.数据预处理的方法 1.多组学数据整合概述 1.1多...[作者空间]
前言 我还未想到这个专题叫什么...... 暂定“XXX就那样”? 我们先来个斗鸡眼,看着一下中间的QT。 1.什...[作者空间]
mGWAS(metabolome-based genome-wide association studies)的研...[作者空间]
众所周知,Proteowizard MSconvert用于质谱原始数据的格式转换,但主要平台是windows,要想...[作者空间]
目的 和转录组或蛋白组的分析原理类似,目的是:将大量的差异代谢物降维到少量的显著富集的代谢通路,方便解释科学问题;...[作者空间]
非靶向代谢组实验设计 1.代谢物提取,一般要求每组至少10个样;2.在所有提取好的样本中取等量混合作为QC;3.Q...[作者空间]
iPath iPath (interactive Pathways Explorer) 是一款可视化的通路图在线分...[作者空间]
代谢物的鉴定流程 蛋白组比基因组和转录组落后一档次,代谢组学比蛋白组又落后一档次,仅化合物的鉴定就让人头疼。 流程...[作者空间]
基本概念 代谢物:所有分子量小于1500Da的小分子物质,包括糖类、核苷、有机酸、酮类化合物、多肽、氨基酸、有机胺...[作者空间]
Abstract 代谢组学分析结合高级遗传群体是研究植物代谢组学的有力工具。然而,水稻(Oryza sativa)...[作者空间]