文献：Muhammad Tahir ul Qamar, Xitong Zhu, Feng Xing, Ling-L...[作者空间]
目前，用于Hi-C辅助基因组组装的软件有LACHESIS、SALSA2、3D-DNA、ALLHiC等，包括这2年发...[作者空间]
在做基因组组装的过程中，当获得contig/scaffold之后，确定基因组的scaffolds/contig的顺...[作者空间]
Bionano数据既可以自己从头de-novo出图谱，也可以依据参考序列混合组装出图谱。 ===从头组装==== ...[作者空间]
前面写过如何用HiC数据进行挂载的，今天开始系统学习一下bionano（也可以做挂载这一步），因为最近接触的一个项...[作者空间]
随着越来越多的植物基因组的组装，人们发现一个单一的参考组装并不能反映一个物种的基因多样性，这导致了泛基因组概念的产...[作者空间]
====环境和测试数据准备===== 需要先安装OrthoFinder，这个参考前面一个帖子。然后今天我们主要来测...[作者空间]
如果一个物种在进化过程中发生了多倍体化，那么，在基因组上就会存在一些共线性区域（即两个区域之间的基因是旁系同源基因...[作者空间]
前言：因为最近陆陆续续接手了几个物种的基因组项目，这也是生信分析中很大的一块。其中最基础的是组装和注释（当然我们实...[作者空间]
。虽然不是学生物或者医学的，但是听了很多生命科学的报告。关于生命的起源、进化——从个体到宇宙，生命是如何从无到有，...[作者空间]
