⚠️不想充值付费的小伙伴可以点赞,会随机挑选幸运观众赠送全文。 NGS分析手把手教学系列继WGS全基因组分析[ht...[作者空间]
拿到NGS全基因组下机序列以后肯定是Fastqc+Cutadapt+Trimmomatic去引物序列,匹配序列对原...[作者空间]
概要 根据RD(Read Depth)来检测CNV(copy number variations)和CNA(cop...[作者空间]
1. 安装 CNVkit是一款基于Python环境的工具,所以安装之前你得确保已经安装好了Python。安装方法有...[作者空间]
目录 前言[https://www.jianshu.com/p/729673778e43] 方法简介[https:...[作者空间]
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众所周知,基因组分析的软件为了效率进行大规模的计算处理,大多数是基于C++。这对于用惯了R语言的同学就很不友好了。...[作者空间]
Shell 是什么 其实在之前的文章里有略微提到过。生信分析中不可或缺的一个伙伴,不管你主打R还是Python,S...[作者空间]
前几回通过动手操作大概了解了K-mer是怎么一回事了,这一回稍微深入一下,透过现象看本质,看一下K-mer背后的数...[作者空间]
在基因组分析 K-mer 第4回[https://www.jianshu.com/p/453240894c57]里...[作者空间]
0608 Cloudy在第二回的文章里我们用k-mer法预测了比较短的序列长度。因为序列本身较短,再加上是预测上的...[作者空间]
0607 Cloudy先定义一下标题里的“估计”两个字在这里是什么意思。根据什么估计什么。 1.根据NGS短序列数...[作者空间]
0525 Cloudy说到编程语言,其实大致可以分成两种,一种是计算机编译器语言,比方说C,C++,优点在于基于计...[作者空间]
0604 Rain 前言 关于k-mer的基础定义和用法,网上有太多的文章解释,什么估计基因长度,杂合程度,最优拼...[作者空间]