1. A single-cell map for the transcriptomic signatures of...[作者空间]
TCseq包提供了一个统一的套件去处理不同时序类型的数据分析,可以应用于转录组或者像ATAC-seq,Chip-s...[作者空间]
之前有一次,我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”,因此,我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇...[作者空间]
经常在基因组或其他组学文章中见到circos图,但是并不知如何解读?以及circos图适用于哪类数据分析结果的展示...[作者空间]
mRNA-seq上中游分析需要用到Linux系统的terminal! 尽管TCGA数据库中已经提供了大量的处理好的...[作者空间]
Hi-C技术源于染色体构象捕获(Chromosome Conformation Capture, 3C)技术,利用...[作者空间]
一般做完差异基因,或者使用其他方法找到想要的biomarker时,想要知道这些基因的调控网络,或者哪些基因在调控网...[作者空间]
三代全长转录组辅助基因预测 1 、简介 目前随着三代测序技术的普及和成本的降低,相信在不久的将来,大面积内使用全长...[作者空间]
最近读了一篇文章名为《LncPipe: A Nextflow-based pipeline for identif...[作者空间]
刘小泽写于19.12.28我又回来啦!在马来西亚疯狂放松一周,体验了当地的风土人情。回来继续学习~感觉活力满满 这...[作者空间]
PWM矩阵是表示motif的一种方式,全称是position-specificweightmatrix(PSWM)...[作者空间]
为啥子开发新包 这要从两个牛批的老包说起。 dplyr 先科普一下dplyr,是Rstudio首席科学家hadly...[作者空间]
进行WGCNA要注意,WGCNA输入(INPUT)的是:行对应着一个样品,列对应着探针的矩阵或者数据框。 0 数据...[作者空间]
测序得到的是几百bp的短read, 相当于把拼图打散了给你。如果没有参考基因组,从头组装会有很大的工作量,而且对于...[作者空间]
下载 EMBOSS下载: http://pan.baidu.com/s/1i4SS5E1 测试文件下载: http...[作者空间]
相信 Entrez 的强大是有目共睹的,BioPython 将它几乎所有操作都封装为方法,使我们可以更加方便的利用...[作者空间]
相信大家在上一文中下载fasta的时候还没有感觉到下载是多么复杂,但是对于分析比对多个序列文件时,这个工作量说多了...[作者空间]
上一篇文章生物信息中的Python 01 | 从零开始处理基因序列自己造轮子实现了序列的基础操作,但是在Pytho...[作者空间]
一、 序列数据的下载 在开始了解序列的处理流程时,我们先要知道序列下载网址。其中一个知名的网站就是NCBI (Na...[作者空间]
配置远程目录 打开Tools -> Deployment -> Configuration 点击左上角+新建一个远...[作者空间]