一、seurat执行差异表达分析 根据单细胞数据预处理的方式不同(lognormalize和sctransform...[作者空间]
日常瞎掰 寻找细胞亚群是单细胞的一个重要的基本任务,后续的分析基本都是基于这些分好的细胞亚群进行的。可见细胞分...[作者空间]
日常瞎掰 通过标题大家已经知道今天我们分享的主要内容了。DoHeatmap这个函数来自于Seurat包,处理过...[作者空间]
NMF算法简介 非负矩阵分解(Non-negative Matrix Factorization, NMF)的思想...[作者空间]
1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后,矩阵默认会变成SCT矩阵,如果不...[作者空间]
相信很多人都看到过上面这种方块图,有点像“华夫饼图”的升级版,也有点像“热图”的离散版。我在一些临床多组学的文章里...[作者空间]