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    • 单细胞转录组GSVA分析更新及可视化
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      2024-03-25
    • 单细胞转录组GSVA分析更新及可视化很久以前,我们在写单细胞分析的时候,就写过GSVA分析了,GSVA分析的全名叫Gene Set Variation...[作者空间]

    • 复现SCI图表:Cellchat多组结果受配体结果气泡图可视化
      0
      2023-07-05
    • 复现SCI图表:Cellchat多组结果受配体结果气泡图可视化最近微信群有小伙伴抛出这样一张图,是一个细胞通讯LR气泡图,确切的说应该是Cellchat结果的可视化。我一看这不...[作者空间]

    • pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新
      0
      2023-06-13
    • pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新****pySCENIC全部往期精彩系列:1、[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=M...[作者空间]

    • 8.4分,基于M2巨噬细胞相关基因的分型文章,可结合单细胞对本文
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      2022-12-12
    • 8.4分,基于M2巨噬细胞相关基因的分型文章,可结合单细胞对本文本文的思路是通过WGCNA分析识别了某种免疫细胞相关的marker基因,然后利用这些基因进行预后模型的构建。事实上...[作者空间]

    • 最新8+非肿瘤生信,单细胞+WGCNA+机器学习+pcr验证,可
      0
      2022-12-01
    • 最新8+非肿瘤生信,单细胞+WGCNA+机器学习+pcr验证,可影响因子:8.78 关于非肿瘤生信,我们也解读过很多,主要有以下类型 1 单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub...[作者空间]

    • 最新7.3分非肿瘤生信,热点基因集+免疫浸润+WGCNA+调控网
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      2022-11-28
    • 最新7.3分非肿瘤生信,热点基因集+免疫浸润+WGCNA+调控网影响因子:7.31 关于非肿瘤生信,我们也解读过很多,主要有以下类型1 单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub基...[作者空间]

    • 文献学习075--[sc]单细胞免疫谱分析揭示新冠疫苗接种后的体
      0
      2022-11-30
    • 文献学习075--[sc]单细胞免疫谱分析揭示新冠疫苗接种后的体1. Durable response of neutralizing antibodies induced by...[作者空间]

    • 单测揭示川崎病治疗前后免疫组成变化
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      2022-11-20
    • 单测揭示川崎病治疗前后免疫组成变化前言 Immugent今天给大家解读一篇去年发表在Nature Communications的文章,题目为:Sin...[作者空间]

    • 文献学习069--[sc+st]单细胞和空间转录组分析揭示结直肠
      0
      2022-11-13
    • 文献学习069--[sc+st]单细胞和空间转录组分析揭示结直肠作者通过整合分析scRNA-seq数据、公开发表的scRNA-seq和bulk RNA-seq数据集、空间转录组数...[作者空间]

    • SCENIC/pySCENIC结果可视化 2022-11-08
      0
      2022-11-08
    • SCENIC/pySCENIC结果可视化 2022-11-08适用背景 之前写了一篇文章介绍四步完成单细胞数据调控网络流程分析[https://www.jianshu.com/...[作者空间]

    • PySCENIC(三):pyscenic单细胞转录因子分析可视化
      0
      2022-11-08
    • PySCENIC(三):pyscenic单细胞转录因子分析可视化更多精彩内容请至我的公众号---KS科研分享与服务先加载需要的R包,都加载了,没毛病。 将loom文件读入R,提取...[作者空间]

    • linux 查看磁盘剩余空间的命令
      0
      2022-09-28
    • linux 查看磁盘剩余空间的命令不同于windows,linux查看硬盘剩余多少空间,是通过命令查看。 Linux磁盘管理常用三个命令为df、du...[作者空间]

    • PySCENIC(一):python版单细胞转录组转录因子分析
      0
      2022-09-23
    • PySCENIC(一):python版单细胞转录组转录因子分析关于单细胞转录组转录因子的分析我们之前在单细胞系列讲过R语言版本的,参考:跟着Cell学单细胞转录组分析(十二):...[作者空间]

    • 文献学习059--[sc+Seq-Scope]脂肪诱导的TREM
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      2022-10-16
    • 文献学习059--[sc+Seq-Scope]脂肪诱导的TREM七月份 (22.7.22) 发表在Science Immunology (IF: 30.630) 的文章 主要关注...[作者空间]

    • 纤维化机制
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      2022-07-20
    • 纤维化机制1. 纤维化 纤维化是由肌成纤维细胞在慢性炎症反应中过度沉积细胞外基质(ECM)蛋白引起的疤痕和组织硬化。多种有害...[作者空间]

    • future——加速你的单细胞分析
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      2022-06-10
    • future——加速你的单细胞分析由于单细胞数据本身就具有数据量大的特点,所以在进行单细胞数据分析时往往会出现运行时间太长的问题。 不过好在 Seu...[作者空间]

    • Seurat分组随机选取细胞数实战(随机采样后找亚群DEG) 2
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      2022-06-01
    • Seurat分组随机选取细胞数实战(随机采样后找亚群DEG) 2关键词 随机取样细胞 Downsample cells 分组随机选取细胞 适用背景 之前的博客提到,R语言处理大数...[作者空间]

    • 一篇单细胞数据挖掘文章的图表复现
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      2022-05-19
    • 一篇单细胞数据挖掘文章的图表复现前言 看到一篇单细胞数据挖掘的文章,题为:Establishment of a Prognostic Model ...[作者空间]

    • 病毒肿瘤数据库-OncoDB 2022版已上线,速来围观!
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      2022-03-14
    • 病毒肿瘤数据库-OncoDB 2022版已上线,速来围观!OncoDB: an interactive online database for analysis of ge...[作者空间]

    • 2022年,TCGA数据建模真的还能到10分吗?
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      2022-02-25
    • 2022年,TCGA数据建模真的还能到10分吗?肿瘤浸润性B细胞和免疫球蛋白(Ig)在肿瘤微环境(TME)和免疫治疗反应均起到重要作用。肿瘤内B细胞产生的IgG抗...[作者空间]

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