很久以前,我们在写单细胞分析的时候,就写过GSVA分析了,GSVA分析的全名叫Gene Set Variation...[作者空间]
最近微信群有小伙伴抛出这样一张图,是一个细胞通讯LR气泡图,确切的说应该是Cellchat结果的可视化。我一看这不...[作者空间]
****pySCENIC全部往期精彩系列:1、[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=M...[作者空间]
本文的思路是通过WGCNA分析识别了某种免疫细胞相关的marker基因,然后利用这些基因进行预后模型的构建。事实上...[作者空间]
影响因子:8.78 关于非肿瘤生信,我们也解读过很多,主要有以下类型 1 单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub...[作者空间]
影响因子:7.31 关于非肿瘤生信,我们也解读过很多,主要有以下类型1 单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub基...[作者空间]
1. Durable response of neutralizing antibodies induced by...[作者空间]
前言 Immugent今天给大家解读一篇去年发表在Nature Communications的文章,题目为:Sin...[作者空间]
作者通过整合分析scRNA-seq数据、公开发表的scRNA-seq和bulk RNA-seq数据集、空间转录组数...[作者空间]
适用背景 之前写了一篇文章介绍四步完成单细胞数据调控网络流程分析[https://www.jianshu.com/...[作者空间]
更多精彩内容请至我的公众号---KS科研分享与服务先加载需要的R包,都加载了,没毛病。 将loom文件读入R,提取...[作者空间]
不同于windows,linux查看硬盘剩余多少空间,是通过命令查看。 Linux磁盘管理常用三个命令为df、du...[作者空间]
关于单细胞转录组转录因子的分析我们之前在单细胞系列讲过R语言版本的,参考:跟着Cell学单细胞转录组分析(十二):...[作者空间]
七月份 (22.7.22) 发表在Science Immunology (IF: 30.630) 的文章 主要关注...[作者空间]
1. 纤维化 纤维化是由肌成纤维细胞在慢性炎症反应中过度沉积细胞外基质(ECM)蛋白引起的疤痕和组织硬化。多种有害...[作者空间]
由于单细胞数据本身就具有数据量大的特点,所以在进行单细胞数据分析时往往会出现运行时间太长的问题。 不过好在 Seu...[作者空间]
关键词 随机取样细胞 Downsample cells 分组随机选取细胞 适用背景 之前的博客提到,R语言处理大数...[作者空间]
前言 看到一篇单细胞数据挖掘的文章,题为:Establishment of a Prognostic Model ...[作者空间]
OncoDB: an interactive online database for analysis of ge...[作者空间]
肿瘤浸润性B细胞和免疫球蛋白(Ig)在肿瘤微环境(TME)和免疫治疗反应均起到重要作用。肿瘤内B细胞产生的IgG抗...[作者空间]