我们常见的转录组表达分析一般都是将reads比对至参考基因组或者转录组上，然后在基因或者转录本水平上定量表达丰度。...[作者空间]
R作图-使用circlize绘制样本物种丰度关联弦状图 circlize图也即是弦图能较好展示样本物种丰度关联关系...[作者空间]
在之前的几篇文章里，介绍了如何整合dada2的分析结果，并且已经通过MicrobiotaProcess包转化为了p...[作者空间]
PICRUSt2 (Phylogenetic Investigation of Communities by Re...[作者空间]
导读 PICRUSt (Phylogenetic Investigation of Communities by ...[作者空间]
. 按代表序列数量过滤 保留总测序量大于3条的代表序列： 2. 偶然因素过滤 为了规避偶然因素，保留至少在2个样品...[作者空间]
昨天下午捣鼓了一下宏基因组物种注释过程(基于nr库)，现在将整个流程记录一下。软件需求：blast，diamond...[作者空间]
1. 高通量测序是探索宏基因组学研究的一个工具 1.1与参考基因组进行Mapping来重构宏基因组Reads 许多...[作者空间]
分析内容如下图所示： 具体分析步骤如下： 数据质控，使用 kneaddata 软件， 该软件先调用 Trimmom...[作者空间]
导读 前面已经介绍了获取菌属相对丰度表的方法，以及多样性分析中的基本概念和计算方法。接下来将开始介绍一种寻找组间差...[作者空间]
QIIME 2不仅可用于处理标记基因分析，而且 在广泛的用户和社区人员参与开发下，已经产生了很多 可用插件 ，在未...[作者空间]
导读 从本篇开始，我将介绍宏基因组分箱的生物信息分析方法。若想了解更多宏基因组分箱的知识请阅读：1. 宏基因组分箱...[作者空间]
