转录组的组装能够提供丰富的组学信息，是生物信息学中重要的基础步骤。测序的下机数据经过过滤，比对，排序，组装，最终得...[作者空间]
邀请并收到一位「GSAman」用户的稿件，非常详尽且实在。相信这份推文可以为一些做功能基因组方面工作的朋友，提供实...[作者空间]
pacbio三代全长转录组数据分析isoseq31 参考官方文档及其他教程，包括原理、流程等 2 软件安装主要参考...[作者空间]
目前热门的单体型基因组组装，以下内容来源于安诺的单体型基因组组装新品发布会单体型也称为单倍型。二倍体有两套染色体单...[作者空间]
SMART-seq2 是 SMART-seq的升级版本（增加：甜菜碱、锁定核苷酸，使cDNA产量加倍）。无论SMA...[作者空间]
写在前面 前两天推了一款「TBtools」新插件，主要目的是方便 PCR 引物设计，尽量从数据层面上确保我们的引物...[作者空间]
问题 安装anyjson==0.3.3这个库，其他库也有可能发生 解决 原因 因为在setuptools 58之后...[作者空间]
VCF (variant callformat) 文件记录了所有样品基因组中所有位置变异（主要包括SNP和InDe...[作者空间]
最好的文档其实还是官方文档。。。http://bioconductor.org/packages/release/...[作者空间]
VarBen（Variant Benchmark） 2021年3月3号，来自 国家卫生健康委临床检验中心、中国科学...[作者空间]
废话不多说，直接简单粗暴的开始吧 导入基因组 导入基因组文件：Genomes→load geome from fi...[作者空间]
现在的第三代测序技术中，主要以PacBio公司的SMRT和Oxford的Nanopore技术为主。与前面的两代技术...[作者空间]
整理了一些目前知道的与组学相关的工具，可能不全面，欢迎补充 基因组学 一代组装 Celera Assembler:...[作者空间]
愿天堂没有头痛 短序列比对的呈现和操纵 Lawrence M, Huber W, Pagès H, Aboyoun...[作者空间]
参考自生信技能树：https://github.com/shenmengyuan/RNA_seq_Biotrain...[作者空间]
IGV脚本批量截图 IGV（Integrative Genomics Viewer）是一款本地即可使用的基因组浏览...[作者空间]
目前尚没有能力直接去阅读htslib的源代码，看到bioawk的代码稍微简单点，因此准备先从这里下手，bioawk...[作者空间]
刘小泽写于18.7.29 写在前面：之前介绍过文本处理的三剑客，grep、sed、awk，也曾说过，学了awk，让...[作者空间]
