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    美文网首页RNASeq 数据分析
    专题列表页
    RNASeq 数据分析

    • 生信分析22:完整的转座子注释流程
      0
      2023-10-18
    • 生信分析22:完整的转座子注释流程本次推送是文献分享22的对应内容。我与生信,公众号:我与生信文献分享22:泛基因组解析柑橘亚科进化以及柑橘果实中柠...[作者空间]

    • tsRNA分类分析:seqac包
      0
      2023-09-02
    • tsRNA分类分析:seqac包标题:tsRNA分类分析:seqac包 tRNA的二级结构如下: 根据其二级结构,tsRNA分类如下: 早期研究报...[作者空间]

    • 跟着NC做基因组数据分析
      0
      2022-12-08
    • 跟着NC做基因组数据分析本期内容为[跟着NC做基因组数据分析],这是你需要的教程,对你一定有帮助。 前言今天花费找文章,看到一篇关于基因组...[作者空间]

    • RNAseq比对流程pipeline脚本
      0
      2022-03-17
    • RNAseq比对流程pipeline脚本自己在参考大牛的基础上,总结了RNAseq比对流程pipeline脚本。在做好前期准备工作后,可以一步完成从fas...[作者空间]

    • 使用edgeR进行无重复差异表达分析
      0
      2020-09-11
    • 使用edgeR进行无重复差异表达分析写这篇文章一部分原因是填2年前的一个坑 转录组入门(7):差异表达分析. 另一部分原因是GQ最近又在搞一波无重复...[作者空间]

    • RNAseq002 转录组入门(2) :数据下载
      0
      2020-08-26
    • RNAseq002  转录组入门(2) :数据下载1 获取文章数据 1.1 获得文章数据地址 AKAP95 regulates splicing through s...[作者空间]

    • 无重复RNA-seq分析
      0
      2020-08-18
    • 无重复RNA-seq分析参考1参考2我试了其中一个方法:[作者空间]

    • R 函数学习 - ComBat_seq
      0
      2020-08-11
    • R 函数学习 - ComBat_seqComBat-seq:使用经验贝叶斯框架调整批处理效果输入raw_count 文件,输出也是count 文件安装(...[作者空间]

    • tximport 将 Salmon 定量结果导入 DESeq2
      0
      2020-07-17
    • tximport 将 Salmon 定量结果导入 DESeq2在《Salmon 进行转录本定量》文章介绍了 Salmon 定量。定量后将数据导入 DESeq2 官网有简单的 t...[作者空间]

    • 【基因组学】使用StringTie+gffread鉴定基因的新转
      0
      2020-07-04
    • 【基因组学】使用StringTie+gffread鉴定基因的新转写在前面 转录组通常被用来寻找差异基因,但是有的时候我们想看一下已报道的基因是否存在可变剪切现象,即新转录本的挖掘...[作者空间]

    • CORNAS摸索
      0
      2020-04-03
    • CORNAS摸索用到CORNAS是因为我拿到了没有重复的样本,想和GFOLD对比一下有何不同详见这篇:我的GFOLD摸索 其实很简...[作者空间]

    • 跟着刘小泽一起回顾标准化方法
      0
      2020-02-20
    • 跟着刘小泽一起回顾标准化方法刘小泽写于2020.2.20常见的差异分析第一步往往是去进行标准化处理,那么究竟标准化的对象是什么?怎么根据具体情...[作者空间]

    • 每月一生信流程之rnaseqDTU
      0
      2020-01-04
    • 每月一生信流程之rnaseqDTU每月一生信流程栏目灵感来自于《铁汉1991》博客的《每日一生信》,他那个时候介绍的主要是生信基础知识,包括数据结构...[作者空间]

    • gfold问题处理记录
      0
      2019-11-14
    • gfold问题处理记录这次在新的服务器上安装gfold的时候,偶然发现GFOLD的官网已经404了,于是索性就conda一套进行安装co...[作者空间]

    • 使用MuSiC分析bulk RNA-seq中的细胞组分
      0
      2019-10-10
    • 使用MuSiC分析bulk RNA-seq中的细胞组分我们之前已经介绍过如何《使用xcell根据表达谱推断样本组成细胞的类型》,具体思路就是根据已知细胞系的表达谱,计算...[作者空间]

    • 如何轻松绘制基因表达聚类趋势图
      0
      2019-10-10
    • 如何轻松绘制基因表达聚类趋势图Davey1369852697@qq.com2019/10/9 ▼更多精彩推荐,请关注我们▼[作者空间]

    • 跟着大神学生信 Jimmy RNA-Seq
      0
      2019-10-03
    • 跟着大神学生信 Jimmy RNA-Seq暴躁版 制约我们的是热情吗?是知识吗? 不,是网速啊,阿西吧! 1 获取SRA号——自己读文献,去pubmend搜...[作者空间]

    • 船新版本 DESeq2 处理大量样本速度显著提升
      0
      2019-09-17
    • 船新版本 DESeq2 处理大量样本速度显著提升太长不看版本 DESeq 最新版本(v1.25.9)针对大样本分析的速度和之前相比有了质的飞越,果子老师的 121...[作者空间]

    • RNA-seq练习 第二部分(基因组序列下载,注释文件下载,索引
      0
      2019-09-25
    • RNA-seq练习 第二部分(基因组序列下载,注释文件下载,索引参考基因组下载有三大全文网站提供参考基因组下载,它们分别是:1.NCBI (https://www.ncbi.nl...[作者空间]

    • Mfuzz进行时序表达聚类分析(Mac)
      0
      2019-09-26
    • Mfuzz进行时序表达聚类分析(Mac)懒癌的我全靠Jimmy催着学习,4月份答应交这份作业的,离中间被催又过了一个多月,今天完成啦。 数据来源: 拟南芥...[作者空间]

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