0.软件的安装略1.物种树的构建参见 https://www.jianshu.com/p/336b65ca1b67...[作者空间]
# rm(list=ls())#clear Global Environment# setwd('F:\\RStu...[作者空间]
蛋白质都是由相似的小型结构域组成的。如果我们有若干个已知的蛋白序列,那我们就可以根据这些蛋白序列比较其含有的保守域...[作者空间]
常规的MEME和进化树可视化,以及其它基因结构/注释信息结合进化树可视化,TBtools已经做的很好https:/...[作者空间]
1.安装 2.运行[作者空间]
1.安装getorganelle 2.安装blast(需依靠其下载各种数据库)先将blast的压缩包下载到Wind...[作者空间]
当下的农业生产中,每年都会遭受来自生物或非生物胁迫带来的损失。想要挽回损失,进行作物抗性育种,就迫切需要理解植物对...[作者空间]
在植物免疫领域,2020-2021年爆发了大量整合ETI和PTI免疫通路的研究。探究ETI和PTI的共调控也成为了...[作者空间]
写在前面 由于circos官网的教程太全面了,虽然好但反而感觉比较复杂,难易上手,因此我将他们精简了一下。由于官网...[作者空间]
写在前面 不少人应该知道,在生物模式,通路,调控机制上,PPT 已然是常规工具之一。类似的,那么画卡通热图,PPT...[作者空间]
简介OrthoFinder是用于比较基因组学的快速,准确和全面的平台。 它查找直系群和直系同源物,推断所有直系群的...[作者空间]
土壤微生物组分析工具 2020年1月出版的SpringerBriefs in Environmental Scie...[作者空间]
作者:ahworld链接:内参基因筛选在线版GeNorm和NormFinder工具发布[https://mp.we...[作者空间]
参考文章:https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Pyth...[作者空间]
写在前面 比较基因组分析已然是常见生信数据分析。开展这类分析时,往往会遇到各式各样的问题,尤其是,输入文件内容和格...[作者空间]
导读 下载、安装、使用MCScanX分析NCBI taxonomy上下载的两个梭菌基因组共线性情况。共线性又称同线...[作者空间]
导读 用mummer,不,是nucmer,做比较基因组,比对完后用mummerplot做可视化踩了三个坑。 mum...[作者空间]
一、4Dtv(四倍简并位点颠换率)的定义 4DTV stands for four-fold synonymous...[作者空间]
写在前面 很久以前,我们推出《热图,还只会用方格子?@所有人,论文热图升阶的时候到了!》这一功能。目前已有一定的用...[作者空间]
在「JCVI教程」编码序列或蛋白序列运行共线性分析流程(上)还是有一个尴尬的事情,就是只用到两个物种,不能展示出J...[作者空间]