今天想看一下自己的序列里面会不会有某细菌基因组存在,主要使用BWA和Samtools: bwa主要用于将低差异度的...[作者空间]
Mapping RNA-seq Reads with STAR 基础用法:Mapping RNA-seq read...[作者空间]
欢迎批评指正 一、上游处理流程 上游处理步骤包括质量检测、质量控制、比对、定量[2],每一步处理数据的目的都是不同...[作者空间]
Swimming downstream: statistical analysis of differential...[作者空间]
参考这些???我觉得学RNA-seq必看的文献!!???这篇写的特别好:RNAseq-workflowRNA-se...[作者空间]
转录组有参分析之STAR比对及可变剪切 STAR比对的特点: 速度快 准确度高 3'reads soft clip...[作者空间]
RNA-seq流程-从SRR下载到得到表达矩阵 1.数据下载 在~/project/new/路径下,将SRR号重定...[作者空间]
Trinity是Broad Institute和Hebrew University of Jerusalem开发的...[作者空间]
这个步骤推荐在R里面做,载入表达矩阵,然后设置好分组信息,统一用DEseq2进行差异分析,当然也可以走走edgeR...[作者空间]