关注公众号,桓峰基因 这期继续补充一下转录组高级分析内容之一的筛选Hub基因,这个模块在 SCI 文章中也是经常出...[作者空间]
公众号原文点我[https://mp.weixin.qq.com/s/sVWseQoyxL5tEM5PDf-iuQ...[作者空间]
2020年10月8日,榕-蜂协同进化研究成果以“Genomes of the banyan tree and po...[作者空间]
功能富集分析 收到测序公司的结果以后,发现一些离谱的通路富集,于是自己想重现一下这个过程,经过一番折腾,终于摸索除...[作者空间]
最近有很多人在给他们做完了WGCNA分析之后,跑过来问结果中各种图片的意思。我就整理一下WGCNA分析结果中常见图...[作者空间]
常用的病毒载体有腺病毒、逆转录病毒和慢病毒。逆转录病毒载体只能感染分裂期细胞,而且容量有限,腺病毒一般不能整合到染...[作者空间]
gff文件当中存储了基因组当中所有基因的注释信息,如果想得到基因组当中所有基因的位置信息可以利用awk命令批量的提...[作者空间]
要进行GO或者KEGG富集分析,就需要知道每个基因对应什么样的GO/KEGG分类,OrgDb就是存储不同数据库基因...[作者空间]
1.首先安装eggnog-mapper软件 注释所需要的物种数据库网址如下,同时也可以用里面的脚本download...[作者空间]
0.清空环境,加载R包 1.GO 富集分析 (1)输入数据 (2)富集 (3)可视化 条带图 气泡图 (3)展示t...[作者空间]
From 生信技能树 的娟老师 1、从数据库中下载之后通过xftp传递到服务器上。(传递到当前目录,利用pwd命...[作者空间]
Integrated bioinformatic analysis revealed biological pro...[作者空间]
Differential gene expression analysis:差异表达基因分析 Differenti...[作者空间]
自己只做了几个样本的RNAseq测序或芯片,发愁文章里没有什么绚丽的图片可放?别着急,我们可以把差异分析的基因拿来...[作者空间]
聚类是基因表达数据分析中的重要工具-转录本以及蛋白质水平。这种无监督的分类技术通常用于揭示隐藏在大型基因表达数据集...[作者空间]
salmon quant 有两种类型一种使用raw reads 另一种用已经比对好的序列(BAM/SAM格式),这...[作者空间]