一、压缩和解压缩 1.“.tar.gz”结尾的文件: tar tar -cf newfile.tar file1 ...[作者空间]
思考题1:什么是生物信息学,如何理解其含义?为什么在大规模测序研究中,生物信息学至关重要? 一、生物信息学有三个方...[作者空间]
BWA[http://bio-bwa.sourceforge.net/]主要是将reads比对到大型基因组上,主要...[作者空间]
拿到数据后我们首先进行质量评估,常用工具为FastQC[https://www.bioinformatics.ba...[作者空间]
一、在B站“生信人应该这样学Linux”第5讲-软件安装 Jimmy大神的软件安装教程,留爪慢慢看。http://...[作者空间]
上已完结,中见https://www.jianshu.com/p/0147afc3334c[https://www...[作者空间]
一、基本操作 1. 使用界面 可以注册后使用,点击upload即可上传树文件 2. 基本操作 右侧controls...[作者空间]
整体流程是Trimmomatic+bwa+samtools+picardtools+GATK GATK4.0之前之前的版本是不包括picard的,这里我们用的是GATK3.8...[作者空间]
进入目标文件夹 分群体的单个个体 计算每个个体的ROH BN 62 BRA 70 Laos ...[作者空间]
最近处理的几组数据使我感觉到生信软件的教程一定要看最新的或官方的,因为现在的技术和方法发展太快了,软件更新换代也非...[作者空间]
写在前面:当学习某一重要文件格式时,更需要对此格式对应软件工具进行全面的学习(如sam/bam——samtools...[作者空间]
1.核酸,基因,DNA,染色体,基因组,同源染色体,等位基因 核酸,基因,DNA,染色体 核酸:一种通常位于细胞核...[作者空间]
今天要介绍的这篇文献是生物信息领域的大神李恒2013年发表于《BIOINFORMATICS》杂志上的 BWA-ME...[作者空间]
1 摘要 这是一篇德国波恩大学 LIMES研究所于2018年发表在《SCIENTIFIC REPORTS》杂志的一...[作者空间]
检测基因组选择信号的方法有很多种,其中 XP-CLR 方法是常用的一种。XP-CLR 是陈华老师、Nick Pat...[作者空间]
Bcftools说明文档 1 简介 BCFtools 是一款多种实用工具的集合,它可以用于处理VCF文件和二进制的...[作者空间]
一、转载https://blog.csdn.net/yangl7/article/details/10932364...[作者空间]
在重测序发表的文章里面,一般最常见的图中包含以上的LD衰减图。通常可以查看LD的距离来指导后续的单体型图以及将来的...[作者空间]
二代测序基础知识 二代测序基础概念 (这个是与二代测序相关每个部门都要掌握的) FQ数据格式 高通量测序(如Ill...[作者空间]
测序公司在释放原始数据的目录下都会有一个MD5文件,对于不太了解MD5的老师,可能会直接忽略这个文件。实际上这个文...[作者空间]