单细胞转录组细胞比例: 关于单细胞比例的计算和作图我们之前出过3期,单细胞比例的展示是很多单细胞文章必不可少的内容...[作者空间]
学习整理from官网[https://smorabit.github.io/hdWGCNA/articles/ba...[作者空间]
此前我们已经花了三篇推送的篇幅去详细介绍了GSVA: 文献阅读系列(九)、一文了解GSVA原理[http://mp...[作者空间]
最近小编收到最多的问题就是想做差异分析,应该选择那种分析方法?数据之间的关系一般分为四种:差异关系、相关关系、影响...[作者空间]
WGCNA原理和分析流程[https://www.jianshu.com/p/9331eb5377d1] 单细胞W...[作者空间]
WGCNA原理和分析流程[https://www.jianshu.com/p/9331eb5377d1] 使用pb...[作者空间]
适用背景 在R语言中,我们需要对字符串、向量和数据框等数据类型进行替换操作,有时候是因为需要更换别名,有时候是因为...[作者空间]
更改横轴顺序(根据实际需要) 自带图美化一下[作者空间]
在进行一些数据分析是经常会需要将一个数据对象转化为矩阵,以及稀疏矩阵(sparse matrix)和稠密矩阵之间的...[作者空间]
无论是单细胞、空间组还是ATAC的数据,有时由于下游分析的需求或可视化的需求,同时由于python的运算速度的优势...[作者空间]
说在前面 在单细胞数据分析流程中,细胞亚群注释的准确性一直都是重中之重,生信宝库在之前的推文:一文解决单细胞亚群注...[作者空间]
之前做单细胞比例图的时候做过堆叠柱状图,(跟着Cell学单细胞转录组分析(六):细胞比例计算及可视化[http:/...[作者空间]
单细胞系列教程目录索引,持续更新...[https://www.jianshu.com/p/98fc6c80c21...[作者空间]
R小盐准备介绍那些小众又好用的生信数据库你想要的R语言学习资料都在这里,快来关注【科研私家菜】 今天R小盐介绍的数...[作者空间]
ScType 数据库(https://sctype.app) 生信人文章:https://mp.weixin.qq...[作者空间]
接着单细胞下游分析: 从Cell学单细胞转录组分析(一):开端!!![http://mp.weixin.qq.co...[作者空间]
前两天遇到了一个小问题:初步注释细胞发现,使用RenameIdents后细胞类型的levels与我想要的排序不符。...[作者空间]
日常瞎掰 通过标题大家已经知道今天我们分享的主要内容了。DoHeatmap这个函数来自于Seurat包,处理过...[作者空间]
文件处理相关 画图相关 变量处理相关 subset操作[作者空间]