测序深度(Sequencing Depth) 相当于测了几遍; 指测序得到的总碱基数(bp)与所测物种基因组大小的...[作者空间]
引言:t-SNE 是一种非线性降维算法,非常适用于高维数据降维到2维或者3维,进行可视化。是单细胞测序高分文章中常...[作者空间]
简介 BWT算法在多款序列比对软件(BWA,bowtie)中都有涉及,那么对于RNA-seq的2代数据,一般建库长...[作者空间]
相关性分析 相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析...[作者空间]
参考:踏踏实实做技术:BWA,Bowtie,Bowtie2的比对算法推导 mapping pipline remo...[作者空间]
一、什么是批次效应 批次效应(batch effect),表示样品在不同批次中处理和测量产生的与试验期间记录的任何...[作者空间]
官网:http://subread.sourceforge.net/ 一、原理 文献参考:featureCount...[作者空间]
目录 标准化1.1. House-keeping gene(s)1.2. spike-in1.3. CPM1.4....[作者空间]
1. 转录组数据统计推断的难题 在RNA-seq中进行两组间的差异分析是最正常不过的了。 我们在其它实验中同样会遇...[作者空间]