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    基因家族分析

    • UPGMA法聚类分析——NTsys2.10e
      0
      2022-09-05
    • UPGMA法聚类分析——NTsys2.10eNTsys是一款强大的统计分析软件,具有多个统计模型组件,在植物多样性分析中经常会用到。其中最主要的模块是聚类分析...[作者空间]

    • 基因家族分析(5)绘制基因结构图
      0
      2022-08-04
    • 基因家族分析(5)绘制基因结构图本节介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server(GSDS),简单好用...[作者空间]

    • 快速 | 蛋白序列两两相似度矩阵计算
      0
      2022-03-06
    • 快速 | 蛋白序列两两相似度矩阵计算写在前面 Emmm,有时候,我们可能通过一些比对软件,如 BLAST , DIAMON 或者 ghostz 得到一...[作者空间]

    • 如何使用SPDE进行共线性分析(MCScanX)
      0
      2021-08-10
    • 如何使用SPDE进行共线性分析(MCScanX)在进行共线性分析的时候需要准备两个文件:一个是blast文件,一个是gff文件。这两个文件都是需要经过相应处理的。...[作者空间]

    • 从pfam数据库下载某个基因家族的HMM模型
      0
      2021-06-16
    • 从pfam数据库下载某个基因家族的HMM模型一、序 目前对蛋白基因家族进行分析主要有两种方法,一基于同源性,二基于HMM模型。 想要通过HMM模型预测蛋白基因...[作者空间]

    • 比较基因组从入门到放弃(3)
      0
      2021-06-16
    • 比较基因组从入门到放弃(3)今来做一哈基因家族收缩与扩张吼用到的软件是 CAFE [基因课 提供的sif环境] 实验室祖传pipeline 后...[作者空间]

    • 物种内共线性圈图绘制
      0
      2021-05-17
    • 物种内共线性圈图绘制本文参考 生信札记[https://www.jianshu.com/u/068665394ccf] 相关内容制作 ...[作者空间]

    • 基因家族分析(4)ggtree绘制高端进化树
      0
      2021-05-15
    • 基因家族分析(4)ggtree绘制高端进化树系统发育树几乎是基因家族文章的必备图,一个好看的树图的确能给文章增色不少,一般的用户可能只使用MEGA绘图,进阶一...[作者空间]

    • 基因家族分析(3) ggplot2绘制基因结构图
      0
      2021-05-13
    • 基因家族分析(3) ggplot2绘制基因结构图本节我们继续来进行基因家族数据可视化的第3节教程,通过ggplot2绘制一个富有美感的基因结构图&蛋白保守结构域图...[作者空间]

    • 基因家族分析(2) ggplot2绘制motif分析图
      0
      2021-05-12
    • 基因家族分析(2) ggplot2绘制motif分析图隔了这么长时间终于开始更新基因家族的第2篇文档了,绘制motif分析图。以往做这类分析都是通过TBtools此款软...[作者空间]

    • 基因家族分析(1) 基因家族成员的鉴定
      0
      2021-05-04
    • 基因家族分析(1) 基因家族成员的鉴定最近有小伙伴问为怎么多快好省的发个论文顺利毕业,作为生物圈里的当事人当然推荐基因家族分析了,于是乎准备整理这一系列...[作者空间]

    • 什么是顺式作用元件?
      0
      2021-04-25
    • 什么是顺式作用元件?顺式作用元件(cis-acting element)存在于基因旁侧序列中能影响基因表达[https://baike...[作者空间]

    • 基因家族功能域可视化--TBtools
      0
      2021-04-21
    • 基因家族功能域可视化--TBtools在基因家族分析中,关于功能域可视化是一个相对比较简单的流程式方法。能够较好地了解不同物种间同一个家族结构域的保守和...[作者空间]

    • 基因家族后续分析
      0
      2021-05-26
    • 基因家族后续分析1.手动确认结构域; SMART:http://www.omicsclass.com/article/681[ht...[作者空间]

    • TBtools | 多图合一至强版教程!进化树 + Motifs
      0
      2021-04-05
    • TBtools | 多图合一至强版教程!进化树 + Motifs放一张效果图,这些,三四年前的东西,我其实一直懒得说。 写在前面 “Gene Structure View (Ad...[作者空间]

    • 基因家族:用python处理blast结果区域延伸的问题
      0
      2020-12-16
    • 基因家族:用python处理blast结果区域延伸的问题tblastn比对出来候选HSP区段,我们需要根据一定的基因长度范围来进行区域延伸去重叠,然后进行exonerat...[作者空间]

    • 如何在NCBI批量下载基因家族序列?
      0
      2020-04-20
    • 如何在NCBI批量下载基因家族序列?在做生信下游基因分析的时候,我们通常需要下载兴趣基因的序列信息构建进化书什么的,如果兴趣基因比较少,那么可以直接在...[作者空间]

    • 植物耐冷调控机制的研究进展
      0
      2020-04-02
    • 植物耐冷调控机制的研究进展低温是主要的严重影响植物生长和发育的环境因子,并且会影响作物的产量。植物演化出了一系列的机制,使它们能够在生理和分...[作者空间]

    • 如何利用NCBI预测基因的结构域和保守位点
      0
      2020-01-02
    • 如何利用NCBI预测基因的结构域和保守位点1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我...[作者空间]

    • 蛋白质三维结构预测、结果解读与评分
      192
      2018-10-11
    • 蛋白质三维结构预测、结果解读与评分蛋白质三维结构预测,只要有目的基因的氨基酸序列就可以做,不限物种,没有太多要求,可为文章增色。windows版本的...[作者空间]

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