写毕业论文的时候老板提到要用一张图表示分类系统的变化,于是像到用桑基图来呈现这个变化的过程,具体操作步骤如下(越来越不喜欢写注释了,大家将就着看):输入表格如图:[作者空间]
DiscoVista是一个可视化多物种树的软件,由python2编写;大家在安装的时候可以单独构建一个python...[作者空间]
Dsuite软件的网站在Github上,GitHub - millanek/Dsuite: Fast calculation of Patterson's D (ABBA-B...[作者空间]
之前有小伙伴反应说是BUSCO很难安装,这里我们使用mamba来进行安装,首先安装mamba 成功!然后开始安装busco, 成功!记得每次使用之前要先用mamba acti...[作者空间]
在进行单拷贝直系同源基因构建系统发育树之前,我们会将一些出现频率比较低的单拷贝直系同源基因过滤掉,这就需要先统计频...[作者空间]
在把序列合并起来以后,如果要用于建树的话,一般在此之前建议看一下序列的常规指数,比如序列的长度、序列的配对相似度、...[作者空间]
最近做了一个祖先状态重建的工作,还是蛮有意思的。PS:需要说一下的是,RASP的祖先状态重建主要是分布区重建,用R...[作者空间]