官网:https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRF[https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TR...[作者空间]
最近看到的一些T2T补gap软件软件: softwareDownloadTimeArticleJournalqua...[作者空间]
「基因组」compleasm评估基因组busco[https://www.jianshu.com/p/8178b1...[作者空间]
最近状态不佳,连续两件事情做的时候只想到了一半,做了又等于没做,都成了自己预想的最差的结果,要想做到最佳,只有重做...[作者空间]
流程github 主页 https://github.com/wjian8/psvcp_v1.01[https:/...[作者空间]
超级泛基因组:代表一个属内所有物种的基因组信息,是对泛基因组的进一步扩展。 2020年发表在TrendinPlan...[作者空间]
背景介绍 verkko是一个最新的可以应用于二倍体基因组T2T(telomere-to-telomere)级别的基...[作者空间]
基因组结构注释主要包括三个方面:从头注释(de novo prediction)、同源注释(homology-ba...[作者空间]
非模式物种 step1:注释把本物种的蛋白序列用diamond到eggnog数据库比对 拿到eggnog的注释结果...[作者空间]
在组装未知基因组时,往往需要利用重测序数据提前进行基因组调查,以获取其基因组规模,杂合率,重复序列比例,GC含量等...[作者空间]
帮助文档 http://www.jstacs.de/index.php/GeMoMa[http://www.jst...[作者空间]
第一步安装软件 第二步转到工作目录 第三步,拼装序列 第四步,导出输出文件[作者空间]
转座子 转座子(transposable element):或称跳跃基因,是一种可以改变其在基因组中位置的DN...[作者空间]
1.安装getorganelle 2.安装blast(需依靠其下载各种数据库)先将blast的压缩包下载到Wind...[作者空间]
HIFI技术的简介 HiFi reads(High fidelity reads) 是Sequel II 三代测序...[作者空间]
1.下载线粒体参考序列 2.构建索引文件 参考Hisat2, Bowtie, Bowtie2和BWA构建基因组索引...[作者空间]
HiFi测序以及hifiasm软件的使用,目前是市场上二倍体动植物基因组组装的最佳选择,没有之一,多倍体目前也是最...[作者空间]
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wtdbg2软件介绍 wdbg2能利用三代Pacbio 或 Nanopore 测序数据进行基因组组装。在组装过程中...[作者空间]
Canu软件简介 Canu软件是Celera Assembler基因组组装软件的一个分支,能利用测序错误率较高的三...[作者空间]