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    基因组理论

    • IBD分析软件germline安装与使用
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      2022-08-24
    • IBD分析软件germline安装与使用Identity by Descent (IBD) :同源相同片段,是在两个及以上个体存在来源于同一祖先的、未发生...[作者空间]

    • illumina 双端测序
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      2022-05-09
    • illumina 双端测序illumina 双端测序(pair end) illumina测序的核心在于利用可逆终止的、荧光标记的dNTP进...[作者空间]

    • Hi-C | 基础介绍
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      2022-03-15
    • Hi-C | 基础介绍一、技术原理 基因组研究的维度可以分为很多种,例如下图所示 其中Hi-C是研究三维结构的一种方法。Hi-C技术源于...[作者空间]

    • 【比较基因组】共线性分析(JCVI)
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      2021-11-22
    • 【比较基因组】共线性分析(JCVI)比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是很漂亮的。 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。上一篇介绍了怎么利...[作者空间]

    • 连锁不平衡以及连锁不平衡衰减
      0
      2021-10-01
    • 连锁不平衡以及连锁不平衡衰减[连锁不平衡粗俗的说就是:这几个基因耍流氓,喜欢抱团遗传,不再随机。而连锁不平衡衰减是指在基因组上,随着物理距离的...[作者空间]

    • 转座子(TE,散在重复)特征及其对基因组影响
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      2021-09-08
    • 转座子(TE,散在重复)特征及其对基因组影响基因组中重复序列大体分为两类:串联重复(Tandem repeats,Tandem Duplication) (T...[作者空间]

    • 七. 植物叶绿体基因组--组装,注释和比较作图(GetOrgan
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      2021-07-23
    • 七. 植物叶绿体基因组--组装,注释和比较作图(GetOrgan一. 简介 叶绿体是绿色植物,藻类和蓝细菌进行光合作用的场所,光合作用将水和二氧化碳转变为有机化合物并放出氧气。叶...[作者空间]

    • 链特异性测序的理解 小RNA链特异性
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      2021-06-21
    • 链特异性测序的理解 小RNA链特异性1、链特异性测序的目的现在二代测序主要有PE和SE两种策略,PE主要用于RNA-seq,SE主要用于小RNA测序(...[作者空间]

    • 位点频谱(SFS)计算
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      2021-04-16
    • 位点频谱(SFS)计算1. 什么是位点频谱(site frequency spectrum)? 位点频谱也叫等位基因频谱(allele ...[作者空间]

    • 名词解释:测序深度&RPKM、FKPM、TPM
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      2020-09-10
    • 名词解释:测序深度&RPKM、FKPM、TPM测序深度(Sequencing Depth) 相当于测了几遍; 指测序得到的总碱基数(bp)与所测物种基因组大小的...[作者空间]

    • 都2020年了,我不允许你不会用phytozome数据库
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      2020-07-11
    • 都2020年了,我不允许你不会用phytozome数据库嗨嗨,好久不见,太久没有更新啦。前几天和老师讨论实验的时候,他提到了这个数据库挺方便,之前只是听说过,没有研究过怎...[作者空间]

    • SNP过滤时常用参数的解析(群体遗传)
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      2020-04-01
    • SNP过滤时常用参数的解析(群体遗传)关于为何要进行SNP的过滤: 第一,低质量和无信息的SNP会影响后续群体结构或GWAS的分析结果,甚至影响后续对生...[作者空间]

    • 简化基因组群体分析
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      2019-12-30
    • 简化基因组群体分析1.stack寻找位点1)数据预处理数据下机经过拆分去接头获得原始数据 由于拆分数据用的引物街头长度不一,获得的原...[作者空间]

    • 简化基因组的测序方法
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      2018-02-19
    • 简化基因组的测序方法RAD-Seq(restriction site-associated DNA sequencing)最开始指的是...[作者空间]

    • NCBI上基因组文件格式及解释
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      2017-07-02
    • NCBI上基因组文件格式及解释最近在对于一些关于基因组的数据进行处理,发现如果在NCBI上下载一个物种例如E. coil的基因组序列之后,有很多...[作者空间]

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