服务器运行中我正在努力完成[作者空间]
数据过滤 简介: 目的去掉低质量的碱基或接头,一般使用两款软件:trim_galore和trimmomatic,他...[作者空间]
DAY5学习内容:过滤和比对 过滤 通过DAY4_fastqc结果,我们开始对数据进行过滤,主要是去除接头和低质量...[作者空间]
开始忙碌起来,作业可能没法扯那么多闲话了。 数据质控 昨天完成了数据格式的转换,接下来就可以对得到的fastq文件...[作者空间]
转录组[作者空间]
软件环境 数据转换: 将SRA转变为fq格式。用到软件fastq-dump,它属于sratools工具包中的一个。...[作者空间]
今天将会用到第二天建立的rnaseq环境及对应文件路径和Day3下载好的.sra数据 今天主要学习内容是配置相关软...[作者空间]
今天开始正式进入RNA-seq分析啦~ 软件安装 由于昨天就已经创建好了新的conda的环境,所以今天只要把用到的...[作者空间]
conda改国际镜像的方法 ...学校的服务器崩溃了,数据没下完。只是用自己电脑跑完,修好后补上[作者空间]
端午安康 今天转录学习第三天,开始进入实战的第一步----数据查找和下载 今天要被自己蠢哭了,自己挖坑自己跳,还给...[作者空间]
闲言碎语 从今天开始转录组学习进入正题啦。要重现的文章是 RNA-Seq Transcriptome Profil...[作者空间]
GEO数据库:基因表达仓库(Gene Expression Omnibus),来源于芯片数据、SAGE、高通量测序...[作者空间]
接触linux有半年了,因为懒一直没有做,现在希望可以跟着老师解决了这个难题,题没有做完,。明天希望可以都做[作者空间]
练习题:1.在主目录下面创建/tmp文件夹,并且使其中包含 1/2/3/4/5 格式的文件夹系列 2.在创建好的文...[作者空间]
迟到了,Day2拖延了那么久...Linux操作系统为生物信息学的数据处理提供了很好的平台,因此,掌握一些高效的L...[作者空间]
今天主要内容-----linux命令 基础命令请看生信星球学习小组Day2笔记--善良土豆 新知识 wc -l:计...[作者空间]
今天的主要任务是练习linux基础命令,然后结合实例练习一下三个重要的命令awk、sed、grep 基础命令: p...[作者空间]
1.转录组测序是什么? 遗传信息储存在细胞核DNA,不考虑体系突变的话,理论上讲一个生命体的每个细胞内的DNA是完...[作者空间]
转录组学习 概念[作者空间]