这里是佳奥！继续转录组分析的学习。 一般我们都是从.fq文件开始的，但是如果是自己寻找数据的话，要多一步骤。 1 ...[作者空间]
一、质控 前面我们从GEO下好了SRA数据并转换为fastq文件，现在需要对fastq文件进行质控，这里用的软件为...[作者空间]
对RNAsq的read count数据进行PCA分析 目的：PCA分析可以得到样本之间的相关性和离散程度。 内容：...[作者空间]
前言：进行RNA-seq入门实战首先需要有一定的linux与R基础，推荐跟着B站生信技能树-jimmy老师学习打牢...[作者空间]
一、什么是RPKM、 FPKM、TPM、CPM RPKM, FPKM and TPM, clearly expla...[作者空间]
在之前的学习和练习里，比对这一步我使用过bowtie2（DNA比对）和hisat2（RNA-seq比对），现在学习...[作者空间]
差异表达分析内容：• 基因表达量的标准化方法及可视化➢ counts，RPKM，FPKM，TPM➢ PCA图、热图...[作者空间]
fastq-dump是常用用来下载NCBI原始测序SRA数据的工具，但是它的参数也是比较杂乱，我根据查到的数据说下...[作者空间]
