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    人体菌群研究

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    • 微刊:三代16S多样性文献导读
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      2022-07-08
    • 微刊:三代16S多样性文献导读Gut 译名:人参多糖改变肠道菌群和犬尿氨酸/色氨酸比例,增强anti-PD-1 / PD-L1免疫疗法的抗肿瘤作...[作者空间]

    • Bracken merge samples
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      2022-07-24
    • Bracken merge samples用了类似构造泛基因组表格的方法 1 kraken2bracken分析 kraken2数据处理 bracken数据处...[作者空间]

    • 跟着Nature Communication学数据分析:R语言利
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      2022-06-02
    • 跟着Nature Communication学数据分析:R语言利论文 Microbiomes in the Challenger Deep slope and bottom-ax...[作者空间]

    • Nat Commun:“死菌”也可改善肠道菌群平衡和免疫代谢稳态
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      2022-06-20
    • Nat Commun:“死菌”也可改善肠道菌群平衡和免疫代谢稳态肠道微生物群落结构对于免疫代谢稳态十分重要,菌群异常与许多疾病有关。前人研究表明,嗜甲烷菌(McB)在体外与人类树...[作者空间]

    • dRep物种集去冗余
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      2022-04-24
    • dRep物种集去冗余drep可对基因组集去冗余,留下非冗余基因组集。从运行过程来看,先进行基因预测,然后用chekm做基因组质控,也因...[作者空间]

    • R: cmultRepl多重贝叶斯0值替换
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      2022-03-15
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    • python: 指定行数切割文本
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      2022-03-04
    • python: 指定行数切割文本一个1089行的文件需要被每100行拆到一个新的文件,最后剩下的放到最后一个文件。即,批量指定行数切割文件。后面就...[作者空间]

    • 一篇医学微生物组16S测序文章必备的六张图 | 微生物专题
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      2022-01-08
    • 一篇医学微生物组16S测序文章必备的六张图 | 微生物专题上期介绍了《一篇医学微生物组16S测序文章必备的五个内容 | 微生物专题》,接下来我们逐一介绍这些必备内容需要用哪...[作者空间]

    • PLSDB:细菌的质粒序列库
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      2021-11-12
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    • 大概是16S从实验到数据分析最全流程了吧
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      2021-04-12
    • 大概是16S从实验到数据分析最全流程了吧原文:https://www.sohu.com/a/270075112_99971433[https://www....[作者空间]

    • 一文完不成qiime2微生物多样性分析(2021版上)
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      2021-01-23
    • 一文完不成qiime2微生物多样性分析(2021版上)之前写过一系列qiim2的教程都是零零散散的记录,里面也有不少命令打错的步骤给各位小伙伴造成了不少的疑惑,恰逢qi...[作者空间]

    • 宏基因组之基因组装
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      2020-10-13
    • 宏基因组之基因组装背景 宏基因组组装,即把短的reads拼装成连续的序列contig,再根据PE等关系将contig拼装成scaff...[作者空间]

    • Paper-18 保存方法和16S rRNA 高变区对肠道微生物
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      2020-08-05
    • Paper-18 保存方法和16S rRNA 高变区对肠道微生物DOI: 10.1128/mSystems.00271-18 重要内容:1 通过高通量测序和生物信息学分析(9,-...[作者空间]

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      2019-11-06
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    • DADA2分析16s扩增子教程(来自Happy Belly Bi
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      2018-11-07
    • DADA2分析16s扩增子教程(来自Happy Belly Bi之前发现了一个网站分享了很多教程,诸如bash,R,16s扩增子和基因组相关的分析教程,网站叫Happy Bell...[作者空间]

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